More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1994 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  100 
 
 
268 aa  531  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  48.23 
 
 
242 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  46.02 
 
 
226 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
230 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  35.11 
 
 
250 aa  105  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 
215 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
246 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  36.31 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  35.58 
 
 
215 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 
268 aa  95.5  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2418  GntR domain protein  39.24 
 
 
251 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172286  decreased coverage  0.00114845 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  37.22 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2979  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
302 aa  92.4  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0803123  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  35.91 
 
 
246 aa  92  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  35.91 
 
 
246 aa  92  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
255 aa  92  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
268 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 
251 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  37.79 
 
 
262 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  35.5 
 
 
242 aa  90.1  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
240 aa  89.7  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 
268 aa  89.4  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  31.9 
 
 
243 aa  89  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.17 
 
 
256 aa  89  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4399  GntR domain protein  35.07 
 
 
250 aa  89  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  35.05 
 
 
222 aa  89  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  33.04 
 
 
226 aa  89  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  33.03 
 
 
253 aa  89  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
231 aa  89  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  35.37 
 
 
251 aa  89  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.43 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.43 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0839  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
235 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  32.75 
 
 
216 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  31.05 
 
 
233 aa  86.3  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  36.28 
 
 
273 aa  86.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
251 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4956  GntR domain protein  34.07 
 
 
258 aa  85.9  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114514  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2385  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
259 aa  85.5  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.655367  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  32.58 
 
 
240 aa  85.9  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  34.12 
 
 
235 aa  85.5  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4590  GntR domain-containing protein  33.47 
 
 
263 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.845166  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  32.19 
 
 
249 aa  85.5  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0022  GntR domain protein  31.71 
 
 
232 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0041  GntR domain-containing protein  31.6 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.63 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2114  GntR domain-containing protein  33.47 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
247 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  32.56 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
216 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  30.13 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  32.58 
 
 
240 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.9 
 
 
263 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  31.84 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  31.2 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.62 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  30.8 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.75 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0503  GntR domain protein  33.63 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232387 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  35.11 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  35.58 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  35.19 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  31 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2160  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.91 
 
 
254 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  33.99 
 
 
234 aa  82  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  30.43 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  29.82 
 
 
245 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3543  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
238 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  32.88 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1787  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160831  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  31.11 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  32 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  28.38 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  32.41 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4555  regulatory protein GntR HTH  31.44 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4061  regulatory protein GntR, HTH  34.84 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36274  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  32.32 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  30.77 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.56 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.56 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.05 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  32.61 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.56 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4617  GntR domain protein  32.08 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.19 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>