More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0393 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  100 
 
 		 238 aa  485  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  79.83 
 
 		 241 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  60.95 
 
 		 215 aa  259  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  60 
 
 		 218 aa  256  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  58.57 
 
 		 218 aa  252  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  58.57 
 
 		 218 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  58.1 
 
 		 218 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  58.1 
 
 		 218 aa  250  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  58.1 
 
 		 218 aa  248  6e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  58.1 
 
 		 218 aa  248  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  58.1 
 
 		 218 aa  248  8e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  58.1 
 
 		 218 aa  248  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  58.1 
 
 		 218 aa  248  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  45.57 
 
 		 239 aa  201  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  44.87 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 233 aa  184  8e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  41.92 
 
 		 241 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  40.79 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  42.86 
 
 		 239 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  37.87 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  34.53 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  35.43 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  32.77 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  32.77 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  32.77 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  33.92 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  33.92 
 
 		 249 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  31 
 
 		 250 aa  122  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.62 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  33.05 
 
 		 253 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  34.33 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  33.47 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  32.02 
 
 		 249 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  32.02 
 
 		 249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  34.86 
 
 		 226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  32.02 
 
 		 249 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  33.33 
 
 		 237 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  35.14 
 
 		 229 aa  118  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  34.22 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.62 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.6 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  33.05 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 253 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  35.14 
 
 		 229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  31 
 
 		 249 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  31 
 
 		 249 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  31 
 
 		 249 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  31.78 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.34 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3744  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.3 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.94 
 
 		 256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0942  GntR domain protein  31.14 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.116574  hitchhiker  0.00459968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2019  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.3 
 
 		 254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.94 
 
 		 256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0272  GntR domain protein  33.05 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.554263 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  30.9 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  31 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  31 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  34.63 
 
 		 237 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  34.44 
 
 		 235 aa  111  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2160  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.87 
 
 		 254 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 270 aa  111  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  31.86 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  30.9 
 
 		 258 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2203  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.6 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  30.51 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  30.47 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  30.47 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  32.19 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  32.74 
 
 		 275 aa  109  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  33.64 
 
 		 272 aa  109  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  28.31 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  31.58 
 
 		 253 aa  109  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  30.43 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  31.53 
 
 		 249 aa  108  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  31.86 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.39 
 
 		 256 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 249 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 232 aa  108  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  33.33 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  31.78 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  32.71 
 
 		 239 aa  108  9.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 230 aa  108  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>