More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3006 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  100 
 
 		 243 aa  464  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4197  GntR domain protein  55.56 
 
 		 246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500456  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  44.35 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  40.62 
 
 		 224 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  41.07 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  41.59 
 
 		 230 aa  142  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  39.64 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  41.78 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  44.44 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  37 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  43.41 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  35.04 
 
 		 241 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  35.11 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  34.53 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.42 
 
 		 245 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1626  GntR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60188  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2592  GntR domain protein  41.76 
 
 		 240 aa  111  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13093  normal  0.0457135 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  36.73 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  36.73 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  33.33 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  36.53 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 270 aa  105  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  36.16 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  36.61 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  42.94 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  29.77 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  39.02 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  36.32 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  35.15 
 
 		 269 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  33.06 
 
 		 253 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.82 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  40.61 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  34.45 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0356  GntR domain-containing protein  36.49 
 
 		 238 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2218  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  35.24 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0409255  hitchhiker  0.007316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  40.85 
 
 		 259 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 225 aa  101  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  38.67 
 
 		 253 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  32.74 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  30 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2203  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  41.82 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  35.27 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  31.02 
 
 		 215 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  42.33 
 
 		 252 aa  99.4  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  32.03 
 
 		 239 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 236 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  33.94 
 
 		 227 aa  99.4  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.78 
 
 		 268 aa  99.4  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  31.86 
 
 		 233 aa  99  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  32.26 
 
 		 258 aa  99  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  35.4 
 
 		 253 aa  99  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 216 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  36.95 
 
 		 216 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2418  GntR domain-containing protein  37.64 
 
 		 238 aa  98.2  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  33.8 
 
 		 227 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  35.24 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  35.53 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  35.32 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  34.96 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  34.96 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  33.77 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  34.96 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  35.16 
 
 		 238 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3744  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  40.85 
 
 		 263 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 337 aa  97.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  34.44 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  34.93 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2019  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  40.85 
 
 		 254 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 219 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  30.49 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5347  transcriptional regulator GntR family  33.78 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  36.24 
 
 		 254 aa  95.9  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  29.03 
 
 		 218 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  29.03 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7453  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  43.87 
 
 		 253 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  33.92 
 
 		 250 aa  95.5  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  35.29 
 
 		 216 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  34.67 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 218 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2160  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  40.24 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1739  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549482  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  34.07 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  34.07 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  34.91 
 
 		 240 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>