More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0095 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  100 
 
 		 237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  48.9 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  49.13 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  49.34 
 
 		 234 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  45.85 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1066  transcriptional regulator NanR  50.44 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624285  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  43.04 
 
 		 258 aa  171  9e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3837  transcriptional regulator NanR  44.3 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0354157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3662  transcriptional regulator NanR  41.85 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215207  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3533  transcriptional regulator NanR  42.92 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.606366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3638  transcriptional regulator NanR  42.49 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3531  transcriptional regulator NanR  42.49 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0974768  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3603  transcriptional regulator NanR  42.49 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.445383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3700  transcriptional regulator NanR  42.49 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0480  regulatory protein GntR HTH  41.67 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0480  transcriptional regulator NanR  41.67 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.426599  normal  0.544762 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3708  transcriptional regulator NanR  41.67 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.012881  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3550  transcriptional regulator NanR  41.67 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0970448  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3521  transcriptional regulator NanR  41.38 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3414  transcriptional regulator NanR  41.67 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111616  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4543  transcriptional regulator NanR  41.38 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.136259  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03086  transcriptional regulator NanR  41.38 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03037  hypothetical protein  41.38 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1517  transcriptional regulator NanR  38.22 
 
 		 234 aa  154  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.822162  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0854  GntR domain protein  37.66 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00310833  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  33.33 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  33.05 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  35.62 
 
 		 249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  36.19 
 
 		 227 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  35.27 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  35.27 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  35.27 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  35.27 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  35.32 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  34.44 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  34.44 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  35.59 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  35.32 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  34.05 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  32.19 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 238 aa  99.4  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  34.35 
 
 		 255 aa  99  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  32.14 
 
 		 258 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2716  GntR domain-containing protein  29.49 
 
 		 379 aa  99.4  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.474503  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 255 aa  99  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1410  GntR domain protein  35.96 
 
 		 237 aa  98.6  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  33.33 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.76 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.76 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  34.08 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.18 
 
 		 256 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  33.47 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  31.84 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  30.8 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  31.7 
 
 		 269 aa  96.3  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  31.65 
 
 		 235 aa  95.9  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 268 aa  95.5  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  33.88 
 
 		 249 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0539  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 247 aa  95.1  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  33.86 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  33.74 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  32.31 
 
 		 253 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  31.19 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  32.31 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3466  GntR domain protein  33.19 
 
 		 255 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  28.81 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  28.21 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0739  GntR domain protein  33.63 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0933877  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  30.54 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  32.77 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  30.37 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  33.46 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0204  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.78 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.502813 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3193  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 248 aa  93.2  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.2 
 
 		 251 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  33.46 
 
 		 249 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.97 
 
 		 255 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  31.9 
 
 		 237 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1739  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 251 aa  92.4  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549482  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3744  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.64 
 
 		 263 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 251 aa  92  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 248 aa  92  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0759  GntR domain protein  32.46 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  30.91 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2019  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.64 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 274 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  30.47 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>