More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2734 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  100 
 
 		 254 aa  493  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3965  regulatory protein GntR HTH  43.58 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 257 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  34.5 
 
 		 257 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  34.2 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  32.92 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  35.37 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  34.05 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  36.36 
 
 		 255 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  36.36 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  33.62 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  37.61 
 
 		 254 aa  102  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  31.14 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.72 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  34.4 
 
 		 239 aa  99.4  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  34.06 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  31.14 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  30.6 
 
 		 241 aa  99.4  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 270 aa  98.6  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 255 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3349  regulatory protein GntR, HTH  31.11 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  29.82 
 
 		 240 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  31.58 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  31.19 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0318  transcriptional regulator PdhR  33.62 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  31.95 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  32.46 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  36.13 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  35.16 
 
 		 248 aa  95.5  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0659  transcriptional regulator PdhR  32.76 
 
 		 254 aa  95.5  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.01329  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00112  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  32.02 
 
 		 254 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  32.02 
 
 		 254 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3489  regulatory protein GntR HTH  32.02 
 
 		 254 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000065438  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  32.02 
 
 		 254 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00111  hypothetical protein  32.02 
 
 		 254 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0201037  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  32.02 
 
 		 254 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.739593 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0117  transcriptional regulator PdhR  32.02 
 
 		 254 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000950379  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0106  transcriptional regulator PdhR  32.02 
 
 		 254 aa  95.5  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0767654  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3546  transcriptional regulator PdhR  32.02 
 
 		 254 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000909517  normal  0.0248062 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  32.89 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  32.46 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  32.75 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  28.7 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  32.89 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  32.89 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  35.87 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  32.89 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  34.6 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  31.17 
 
 		 241 aa  94.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  36.53 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  34.08 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  32.02 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  29.74 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 288 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  34.08 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  35.16 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  34.08 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  31.9 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0164  transcriptional regulator PdhR  31.9 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.754019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  31.9 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0165  transcriptional regulator PdhR  31.9 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0430  transcriptional regulator PdhR  32.89 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096101 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0164  transcriptional regulator PdhR  31.9 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  32.03 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  32.46 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  32.46 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  32.46 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 235 aa  92.8  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  33.03 
 
 		 252 aa  92.8  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 303 aa  92.8  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  32.46 
 
 		 250 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  31.74 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03465  transcriptional regulator PdhR  31.72 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 267 aa  92.4  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 255 aa  92  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3778  transcriptional regulator PdhR  33.49 
 
 		 250 aa  92  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  33.04 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  35.74 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  35.86 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  33.95 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  31.22 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  32.61 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>