More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_19880 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_19880  transcriptional regulator  100 
 
 
256 aa  497  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4384  GntR family transcriptional regulator  48.26 
 
 
242 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4471  GntR family transcriptional regulator  48.26 
 
 
242 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.788198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4765  GntR family transcriptional regulator  48.26 
 
 
242 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3342  GntR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
246 aa  175  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0453  regulatory protein GntR HTH  42.13 
 
 
246 aa  171  9e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0156183  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0375  GntR domain protein  45.58 
 
 
234 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400874  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05160  transcriptional regulator, GntR family  44.67 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3039  GntR domain protein  46.22 
 
 
251 aa  164  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5224  GntR domain protein  38.3 
 
 
244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2132  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 
246 aa  116  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2896  GntR domain protein  38.39 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0843059  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12010  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  37.25 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
238 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  27.35 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0204  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.56 
 
 
257 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.502813 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  27.95 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  27.95 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  36.88 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4399  GntR domain protein  35.56 
 
 
250 aa  77  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.25 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3744  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.02 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  30.36 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  31.08 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3258  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  26.61 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  32.48 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2019  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.55 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230363  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02849  DNA-binding transcriptional dual regulator, glycolate-binding  26.61 
 
 
254 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0051984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0716  GntR domain protein  26.61 
 
 
254 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3153  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  26.61 
 
 
254 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0720  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  26.61 
 
 
254 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02799  hypothetical protein  26.61 
 
 
254 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00647704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3440  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  26.61 
 
 
254 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2160  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.92 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.88 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  27.59 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  26.11 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  34.88 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.88 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.33 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2203  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.24 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  34.64 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  24.45 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  35.22 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  28.7 
 
 
255 aa  72  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  24.78 
 
 
228 aa  72  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  26.61 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  33.13 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  28.33 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1653  putative regulatory protein  28.71 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.989828 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  33.12 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1645  putative regulatory protein  30 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1629  putative regulatory protein  30 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1795  putative regulatory protein  30 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  29.36 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1712  putative regulatory protein  30 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  31.54 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  31.2 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4265  GntR domain-containing protein  29.72 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2418  GntR domain protein  31.67 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172286  decreased coverage  0.00114845 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  29.44 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  33.73 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  29.82 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  29.6 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  30.64 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  31.37 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  29.65 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  28.38 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3055  regulatory protein GntR HTH  28.21 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  30.67 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1410  GntR domain protein  29.57 
 
 
237 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  29.1 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  31.43 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4910  GntR domain protein  29.49 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393149  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  28.82 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  30.54 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3833  GntR domain protein  29.49 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  31.95 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3349  regulatory protein GntR, HTH  27.63 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  30.77 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  30.43 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 
318 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  30.67 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  30.67 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>