More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7371 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  100 
 
 
260 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5224  GntR domain protein  42.8 
 
 
244 aa  171  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4765  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4384  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4471  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.788198 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3342  GntR family transcriptional regulator  39.37 
 
 
246 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05160  transcriptional regulator, GntR family  43.35 
 
 
253 aa  149  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2896  GntR domain protein  43.33 
 
 
256 aa  145  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0843059  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12010  transcriptional regulator, GntR family  42.98 
 
 
261 aa  145  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2132  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
246 aa  142  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0375  GntR domain protein  38.22 
 
 
234 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400874  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0453  regulatory protein GntR HTH  36.02 
 
 
246 aa  133  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0156183  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3039  GntR domain protein  38.96 
 
 
251 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19880  transcriptional regulator  36.04 
 
 
256 aa  103  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
233 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  35.4 
 
 
235 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 
255 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  36.12 
 
 
255 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  30 
 
 
233 aa  95.5  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  32.75 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  34.08 
 
 
230 aa  94  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  28.05 
 
 
233 aa  94  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  34.65 
 
 
236 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  35.29 
 
 
235 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  31.72 
 
 
237 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  35.24 
 
 
255 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  28.26 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  27.9 
 
 
228 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  30.53 
 
 
270 aa  90.1  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  27.9 
 
 
228 aa  89.7  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
255 aa  88.6  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  30.67 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.36 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  33.78 
 
 
235 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
238 aa  87  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  33.49 
 
 
231 aa  87  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  35.07 
 
 
224 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  36.11 
 
 
254 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
252 aa  86.3  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  32.16 
 
 
255 aa  85.9  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  32.56 
 
 
269 aa  85.9  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  36.67 
 
 
271 aa  85.5  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  29.06 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  30.51 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.97 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.97 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  29.6 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.86 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  33.49 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2607  GntR domain protein  34.43 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0794563 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  31.14 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  27.85 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  33.61 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2102  transcription regulator protein  33.79 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  28.51 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  31.47 
 
 
255 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  36.08 
 
 
251 aa  82  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
218 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  31.76 
 
 
231 aa  81.6  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  31.43 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  33.04 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  31.82 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  36.87 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  31.3 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  26.29 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  32 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  30 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1761  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.0126946 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1972  putative pyruvate dehydrogenase complex repressor  33.65 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510687  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  31.03 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  28.51 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  28.17 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  31.03 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2541  transcriptional regulator  30.97 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5710  GntR domain protein  33.33 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0750  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
239 aa  78.6  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33475  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  30.88 
 
 
249 aa  79  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  32.57 
 
 
262 aa  78.6  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1674  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
246 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  30.67 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  29.34 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  33.48 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>