More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5755 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  100 
 
 		 234 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  60.26 
 
 		 235 aa  287  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  52.49 
 
 		 236 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  50.46 
 
 		 234 aa  194  7e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3543  GntR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 242 aa  194  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4243  GntR domain-containing protein  55.62 
 
 		 175 aa  191  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.318263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  47.35 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  33.64 
 
 		 250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  37.91 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  32.3 
 
 		 240 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 265 aa  104  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  37.44 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  37.73 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3660  GntR-like  35.96 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.596872  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  36.12 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  42.24 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  35.78 
 
 		 272 aa  102  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  37.8 
 
 		 232 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 268 aa  101  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  38.16 
 
 		 242 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  32.17 
 
 		 258 aa  99  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  34.09 
 
 		 229 aa  98.2  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  32.9 
 
 		 239 aa  96.3  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 270 aa  96.3  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 243 aa  95.9  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  36.07 
 
 		 299 aa  96.3  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  27.19 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  36.7 
 
 		 249 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  36.67 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  36.04 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2500  GntR domain protein  33.94 
 
 		 248 aa  95.1  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 241 aa  95.1  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  38.39 
 
 		 225 aa  94.7  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1469  GntR domain protein  35.98 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3567  GntR domain-containing protein  36.75 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 337 aa  94.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4768  GntR domain-containing protein  41.38 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  35.78 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  37.2 
 
 		 242 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  35.78 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  34.72 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  40.89 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  35.02 
 
 		 253 aa  92.8  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  33.01 
 
 		 227 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.56 
 
 		 255 aa  92  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  34.68 
 
 		 250 aa  92.4  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  33.33 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 259 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000856086  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  33.33 
 
 		 254 aa  92  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  26.73 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 219 aa  92  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03086  transcriptional regulator NanR  33.91 
 
 		 263 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  35.38 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  35.02 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3521  transcriptional regulator NanR  33.91 
 
 		 260 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03037  hypothetical protein  33.91 
 
 		 263 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  32.13 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0553  GntR domain protein  34.51 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4543  transcriptional regulator NanR  33.91 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.136259  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0480  regulatory protein GntR HTH  33.78 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143431  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3550  transcriptional regulator NanR  33.78 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0970448  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 245 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 247 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3708  transcriptional regulator NanR  33.78 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.012881  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3414  transcriptional regulator NanR  33.78 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0480  transcriptional regulator NanR  33.78 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.426599  normal  0.544762 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  30.32 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3719  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  31.91 
 
 		 261 aa  89.7  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  36.7 
 
 		 249 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  36.7 
 
 		 249 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  35.07 
 
 		 273 aa  89.4  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  34.95 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 244 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 226 aa  89  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6253  GntR domain protein  32.57 
 
 		 256 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  36.24 
 
 		 240 aa  88.6  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8124  GntR domain protein  34.39 
 
 		 250 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  28.32 
 
 		 227 aa  88.6  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 240 aa  88.2  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 230 aa  88.2  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  34.07 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3287  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0416745  normal  0.920841 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.09 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3102  GntR domain-containing protein  30.26 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  33.04 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3247  Uxu operon transcriptional regulator  26.61 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>