More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3543 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3543  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  61.3 
 
 		 231 aa  281  5.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  59.91 
 
 		 234 aa  273  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  55.71 
 
 		 242 aa  227  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  49.15 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  47.66 
 
 		 234 aa  194  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  45.37 
 
 		 236 aa  188  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4243  GntR domain-containing protein  46.43 
 
 		 175 aa  152  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.318263 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  34.74 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  31.31 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  33.04 
 
 		 250 aa  99.4  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 233 aa  99.4  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 252 aa  98.6  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  32.73 
 
 		 273 aa  97.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  30.81 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  33.49 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 251 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 238 aa  95.5  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  32.08 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 268 aa  92.8  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  34.39 
 
 		 299 aa  92  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  35.15 
 
 		 262 aa  92  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  34.15 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  31.13 
 
 		 272 aa  90.1  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 268 aa  90.1  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  32.67 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  33.96 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 242 aa  89  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  32.8 
 
 		 215 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  30.99 
 
 		 249 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 232 aa  88.2  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  36.36 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  29.13 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  36.71 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  26.05 
 
 		 252 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  28.04 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  33.03 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  30.99 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  32.08 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  31.92 
 
 		 252 aa  85.9  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 233 aa  85.9  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  33.17 
 
 		 250 aa  85.5  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  30.81 
 
 		 231 aa  85.5  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 274 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  30.91 
 
 		 240 aa  85.1  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.02 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2500  GntR domain protein  32.41 
 
 		 248 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  32.83 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  32.83 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  28.96 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3664  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.514259  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  30.99 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  31 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3401  GntR domain-containing protein  36.45 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.08 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1886  GntR domain-containing protein  33.93 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  30.99 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  30.91 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  28.29 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  32.16 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  32 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  32.52 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  34.93 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  28.51 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  32.73 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  32.71 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  29.96 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  29.63 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  28.44 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  27.8 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  32.29 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5617  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  29.57 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  30.66 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  31.71 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  31 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  35.07 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  31.2 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  31.96 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  28.85 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  30.73 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  33.16 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>