More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4351 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4351  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 265 aa  520  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2929  GntR domain-containing protein  75.78 
 
 		 257 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2543  GntR domain-containing protein  61.72 
 
 		 260 aa  279  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4400  GntR domain-containing protein  53.82 
 
 		 269 aa  224  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.367956  normal  0.0999899 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1414  GntR family transcriptional regulator  52.42 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  41.53 
 
 		 270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 255 aa  182  7e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  38.8 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  40.17 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  41.78 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1719  GntR domain-containing protein  44.44 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.938764  hitchhiker  0.00929417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  43.04 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 255 aa  170  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0659  transcriptional regulator PdhR  40.4 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.01329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  36.4 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  38.4 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  36.73 
 
 		 258 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0418  transcriptional regulator PdhR  39.75 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0430  transcriptional regulator PdhR  40.17 
 
 		 250 aa  158  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096101 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0164  transcriptional regulator PdhR  39.66 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0165  transcriptional regulator PdhR  39.66 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3492  transcriptional regulator PdhR  38.56 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.593618  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  39.66 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  39.66 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0164  transcriptional regulator PdhR  39.66 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.754019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3364  transcriptional regulator PdhR  38.56 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0485553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1035  transcriptional regulator PdhR  38.56 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.778574  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00112  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  38.79 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3489  regulatory protein GntR HTH  38.79 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000065438  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 255 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  38.79 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0106  transcriptional regulator PdhR  38.79 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0767654  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  38.79 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3546  transcriptional regulator PdhR  38.79 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000909517  normal  0.0248062 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  38.79 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.739593 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00111  hypothetical protein  38.79 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0201037  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0117  transcriptional regulator PdhR  38.79 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000950379  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  35.97 
 
 		 250 aa  155  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0318  transcriptional regulator PdhR  39.33 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  37.4 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  35.97 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4809  transcriptional regulator PdhR  34.9 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  35.97 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  36.58 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  35.97 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  35.97 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  36.58 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  36.58 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  36.58 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  35.97 
 
 		 250 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  36.19 
 
 		 250 aa  152  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3569  transcriptional regulator PdhR  38.3 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  41.41 
 
 		 261 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3349  regulatory protein GntR, HTH  36.21 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  40.27 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  35.18 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  38.3 
 
 		 254 aa  148  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3755  transcriptional regulator PdhR  37.87 
 
 		 254 aa  148  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3778  transcriptional regulator PdhR  37.45 
 
 		 250 aa  148  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0673  transcriptional regulator PdhR  38.3 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  38.24 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2626  transcriptional regulator PdhR  34.39 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  38.24 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  38.24 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  41.1 
 
 		 256 aa  141  9e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  36.48 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2019  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  37.15 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3744  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  37.15 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002549  transcriptional repressor for pyruvate dehydrogenase complex  35.44 
 
 		 255 aa  139  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2160  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  36.76 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03465  transcriptional regulator PdhR  36.22 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  34.93 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2203  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  36.33 
 
 		 255 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 255 aa  135  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.84 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0204  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.25 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.502813 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  39.07 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 318 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 228 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  36.36 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 366 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  34.71 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02849  DNA-binding transcriptional dual regulator, glycolate-binding  32.6 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0051984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0716  GntR domain protein  32.6 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3258  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.6 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0720  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.6 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3440  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.6 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>