More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7478 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7478  glc operon transcriptional activator  100 
 
 		 247 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1083  GntR domain protein  44.89 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3296  transcriptional regulator, GntR family  39.29 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.98008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3843  GntR domain protein  33.91 
 
 		 254 aa  93.6  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  31.71 
 
 		 245 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4061  regulatory protein GntR, HTH  33.18 
 
 		 242 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1852  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.232609  normal  0.988084 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  31.49 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2282  regulatory protein GntR, HTH  32.26 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1846  regulatory protein GntR, HTH  38.15 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2588  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1761  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.0126946 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2629  GntR domain protein  32.89 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2061  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2107  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924044  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2044  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.883511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1733  regulatory protein GntR HTH  31.56 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1633  regulatory protein GntR HTH  31.96 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  26.09 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0744  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  26.58 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0527  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  26.16 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4412  GntR domain protein  29.28 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  31.88 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  27.57 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  30.94 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0750  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33475  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  30.45 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  29.09 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3513  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  24.69 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.494425  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2080  GntR domain protein  30.28 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3387  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  26.05 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4787  GntR domain protein  29.96 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1565  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1795  putative regulatory protein  24.2 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  30.28 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1645  putative regulatory protein  24.2 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1629  putative regulatory protein  24.2 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1712  putative regulatory protein  24.2 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  26.29 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1653  putative regulatory protein  24.2 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.989828 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2675  transcriptional regulator GntR  28.63 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  28.12 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  29.39 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4409  GntR domain protein  35.04 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1157  GntR-like  28.16 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00396004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4102  GntR domain protein  27 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0881  GntR domain protein  31.36 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4649  GntR domain protein  29.7 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  28.25 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  28.24 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  31.38 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04193  DNA-binding transcriptional repressor  28.37 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3673  regulatory protein GntR HTH  28.37 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  29.8 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  27.73 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2541  transcriptional regulator  28.91 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  29.61 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3740  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.37 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.714727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  31.79 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04155  hypothetical protein  28.37 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  29.41 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0726  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1326  GntR domain protein  29.68 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4789  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.37 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5830  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.37 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5356  transcriptional regulator GntR family  25.94 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.780742  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4923  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.37 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  24.45 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4550  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.37 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  27.52 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4270  hypothetical protein  31.5 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1596  GntR domain-containing protein  27 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387143  hitchhiker  0.00000232868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  30.84 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  54.55 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5340  GntR domain protein  28.71 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0345729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  32.12 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5710  GntR domain protein  28.85 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1699  GntR domain-containing protein  29.82 
 
 		 513 aa  55.5  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.330463  hitchhiker  0.0000606357 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0037  GntR domain protein  34.06 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  28.02 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4851  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.37 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>