More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3296 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3296  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 250 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.98008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7478  glc operon transcriptional activator  39.29 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1083  GntR domain protein  29.67 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3843  GntR domain protein  32.89 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2061  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 240 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2044  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 240 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.883511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2107  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 240 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924044  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4061  regulatory protein GntR, HTH  33.05 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1761  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.0126946 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  29.18 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1674  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2306  GntR domain protein  29.21 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0386397 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  31.52 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1733  regulatory protein GntR HTH  31.61 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  30.05 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  27.27 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2282  regulatory protein GntR, HTH  32.29 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2080  GntR domain protein  43.06 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3609  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2588  GntR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3301  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1852  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.232609  normal  0.988084 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  30.39 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4409  GntR domain protein  32.85 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0940  GntR domain protein  27.56 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1846  regulatory protein GntR, HTH  31.76 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  44.62 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  53.85 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0497  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2079  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420159  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0508  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0519  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  27.27 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  29.75 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4765  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4384  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4471  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.788198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4412  GntR domain protein  27.62 
 
 		 243 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  38.94 
 
 		 251 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1964  transcriptional regulator, GntR family  28.88 
 
 		 233 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  28.64 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1326  GntR domain protein  39.44 
 
 		 264 aa  52.4  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  31.55 
 
 		 256 aa  52.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 246 aa  52  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 251 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 255 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 258 aa  52  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4834  regulatory protein GntR HTH  38.89 
 
 		 269 aa  52  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5379  transcriptional regulator, GntR family  30.98 
 
 		 252 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  29.57 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2117  transcription regulator protein  27.07 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.930818 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  29.29 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4320  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.196319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1719  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2979  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 302 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0803123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  27.91 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1633  regulatory protein GntR HTH  40.28 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  22.68 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  22.68 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4103  GntR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4817  GntR domain protein  28.39 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0551  regulatory protein GntR HTH  28.37 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.838284  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4855  GntR domain-containing protein  29.8 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  29.13 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  22.44 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4063  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5342  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 233 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.912563 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 231 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3448  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3093  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 220 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.744122 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1580  GntR domain protein  30.17 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  26.09 
 
 		 231 aa  48.9  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1606  histidine utilization repressor  42.86 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.971553  normal  0.693248 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 245 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2257  transcriptional regulator, GntR family  28.25 
 
 		 252 aa  48.9  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.968354 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 218 aa  48.9  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 274 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2647  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  33.73 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  27.63 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5340  GntR domain protein  26.98 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0345729 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  34.18 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05160  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4258  GntR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2925  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  34.88 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.608421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3412  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  26.15 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>