More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1606 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1606  histidine utilization repressor  100 
 
 		 244 aa  495  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.971553  normal  0.693248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6454  GntR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 245 aa  198  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2358  histidine utilization repressor  44.02 
 
 		 244 aa  195  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0429  histidine utilization repressor  40.77 
 
 		 248 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.245315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4909  GntR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 248 aa  194  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5035  histidine utilization repressor  40.34 
 
 		 248 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5924  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  42.36 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354183  normal  0.182633 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67420  histidine utilization genes repressor protein  41.3 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5085  histidine utilization repressor  40.34 
 
 		 248 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5838  histidine utilization repressor  41.48 
 
 		 250 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6920  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  41.92 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1261  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  40.08 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2647  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  40.34 
 
 		 251 aa  184  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0358  histidine utilization repressor  38.79 
 
 		 249 aa  184  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.824022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1300  histidine utilization repressor  42.73 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1656  histidine utilization repressor  45.58 
 
 		 235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00445076  normal  0.818618 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2547  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  41.67 
 
 		 242 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0366  histidine utilization repressor  38.36 
 
 		 273 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5049  histidine utilization repressor  38.89 
 
 		 251 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00586645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  39.21 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4635  GntR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 233 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0895  GntR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2988  histidine utilization repressor  39.3 
 
 		 241 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5172  histidine utilization repressor  37.5 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2511  histidine utilization repressor  37.18 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0551986 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2112  histidine utilization repressor  37.18 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4219  GntR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2221  histidine utilization repressor  36.75 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0869  histidine utilization repressor  40.61 
 
 		 247 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.287597  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0927  histidine utilization repressor  40.61 
 
 		 247 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  40.09 
 
 		 245 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1438  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1099  histidine utilization repressor  38.86 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1262  GntR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  41.41 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2946  histidine utilization repressor  38.86 
 
 		 231 aa  168  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5106  histidine utilization repressor  40.68 
 
 		 252 aa  168  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0814369  hitchhiker  0.00493265 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6444  transcriptional regulator, GntR family  37.55 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1531  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  38.86 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.250236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0704  histidine utilization repressor  32.17 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2188  histidine utilization repressor  39.22 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1686  GntR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5906  histidine utilization repressor  39.22 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2171  histidine utilization repressor  39.22 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.39027  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5481  histidine utilization repressor  38.43 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1040  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  44.25 
 
 		 686 aa  165  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2087  histidine utilization repressor  38.86 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1165  histidine utilization repressor  38.16 
 
 		 236 aa  166  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2078  histidine utilization repressor  36.84 
 
 		 251 aa  166  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2210  histidine utilization repressor  38.86 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0826  histidine utilization repressor  37.23 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000366249  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3644  histidine utilization repressor  39.65 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3583  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1044  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1813  histidine utilization repressor  37.99 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.167757 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4559  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  36.75 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2795  histidine utilization repressor  37.72 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0646  histidine utilization repressor  37.72 
 
 		 231 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1680  histidine utilization repressor  37.72 
 
 		 231 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2365  histidine utilization repressor  37.72 
 
 		 231 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366137  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2666  histidine utilization repressor  37.72 
 
 		 231 aa  161  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154672  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2920  histidine utilization repressor  37.72 
 
 		 231 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2722  histidine utilization repressor  37.72 
 
 		 231 aa  161  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4638  transcriptional regulator, GntR family  37.27 
 
 		 247 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3606  histidine utilization repressor  37.72 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2386  histidine utilization repressor  37.28 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003719  histidine utilization repressor  34.35 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.746481  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00724  histidine utilization repressor  37.66 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0579746  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5462  histidine utilization repressor  37.72 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02076  hypothetical protein  34.63 
 
 		 235 aa  159  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1033  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family protein  33.77 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3722  histidine utilization repressor  37.28 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4641  histidine utilization repressor  37.28 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3799  histidine utilization repressor  37.28 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4840  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  40.35 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.180839 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3905  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1750  GntR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 254 aa  155  7e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0970545  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5005  histidine utilization repressor  36.84 
 
 		 231 aa  154  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1821  histidine utilization repressor  35.96 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5963  transcriptional regulator GntR family  37.99 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0075  histidine utilization repressor  37.83 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  37.83 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1823  histidine utilization repressor  39.47 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325999  normal  0.489419 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1824  GntR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.484103 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  37.83 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4895  histidine utilization repressor  37.39 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  37.83 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2581  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 247 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3954  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family protein  38.81 
 
 		 247 aa  152  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4940  histidine utilization repressor  35.24 
 
 		 254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5445  histidine utilization repressor  36.96 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0118538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5835  histidine utilization repressor  37.56 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4839  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  37.1 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.187571 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5618  histidine utilization repressor  37.39 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.214724 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4170  histidine utilization repressor  38.29 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0148  histidine utilization repressor  35.24 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4068  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4839  histidine utilization repressor  37.56 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3229  histidine utilization repressor  37.39 
 
 		 245 aa  149  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>