More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00724 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00724  histidine utilization repressor  100 
 
 		 234 aa  478  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0579746  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2547  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  62.82 
 
 		 242 aa  293  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1300  histidine utilization repressor  52.84 
 
 		 237 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2358  histidine utilization repressor  52.81 
 
 		 244 aa  245  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1656  histidine utilization repressor  52.81 
 
 		 235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00445076  normal  0.818618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4635  GntR family transcriptional regulator  49.78 
 
 		 233 aa  223  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6454  GntR family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 245 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1040  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  54.98 
 
 		 686 aa  222  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2988  histidine utilization repressor  46.98 
 
 		 241 aa  211  7.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6920  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  46.55 
 
 		 239 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6444  transcriptional regulator, GntR family  44.4 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1438  GntR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5924  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  45.69 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354183  normal  0.182633 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0869  histidine utilization repressor  47.41 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.287597  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0927  histidine utilization repressor  47.41 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4638  transcriptional regulator, GntR family  42.36 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1686  GntR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 226 aa  192  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5963  transcriptional regulator GntR family  43.16 
 
 		 249 aa  179  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1606  histidine utilization repressor  37.66 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.971553  normal  0.693248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4219  GntR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4087  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  41.97 
 
 		 195 aa  151  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.489248 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  35.37 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  34.5 
 
 		 245 aa  142  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  36.68 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3001  GntR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.471781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0358  histidine utilization repressor  34.33 
 
 		 249 aa  138  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.824022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0148  histidine utilization repressor  34.5 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5085  histidine utilization repressor  33.76 
 
 		 248 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2976  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 242 aa  135  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0845294  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4909  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 248 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0429  histidine utilization repressor  33.76 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.245315  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5035  histidine utilization repressor  33.76 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0075  histidine utilization repressor  35.78 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3583  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0366  histidine utilization repressor  34.58 
 
 		 273 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1262  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  131  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3644  histidine utilization repressor  34.93 
 
 		 256 aa  131  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5172  histidine utilization repressor  34.17 
 
 		 249 aa  131  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0826  histidine utilization repressor  33.19 
 
 		 236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000366249  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  34.91 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2647  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  35.34 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  34.91 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1044  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 269 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3229  histidine utilization repressor  34.48 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259882 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4895  histidine utilization repressor  34.05 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67420  histidine utilization genes repressor protein  33.33 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0895  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 251 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5838  histidine utilization repressor  33.48 
 
 		 250 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5445  histidine utilization repressor  33.62 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0118538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1261  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  33.62 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  34.48 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4940  histidine utilization repressor  33.62 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5049  histidine utilization repressor  33.76 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00586645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4559  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  32.02 
 
 		 253 aa  125  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1099  histidine utilization repressor  33.66 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1165  histidine utilization repressor  32.46 
 
 		 236 aa  125  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0939  histidine utilization repressor  32.47 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.997369  normal  0.595643 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5923  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  31.58 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113874 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0853  histidine utilization repressor  32.47 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0825  histidine utilization repressor  32.47 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1813  histidine utilization repressor  31.14 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.167757 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02076  hypothetical protein  30.57 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3642  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0916  histidine utilization repressor  32.47 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0397561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0884  histidine utilization repressor  32.47 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2511  histidine utilization repressor  31.62 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0551986 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2112  histidine utilization repressor  31.62 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0704  histidine utilization repressor  29.07 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2087  histidine utilization repressor  32.68 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2210  histidine utilization repressor  32.68 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1531  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  30.7 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.250236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1750  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 254 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0970545  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2946  histidine utilization repressor  31.14 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2188  histidine utilization repressor  32.68 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6916  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  31.14 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4702  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0392151  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5481  histidine utilization repressor  30.57 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2105  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  35.02 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.871595  normal  0.158429 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2171  histidine utilization repressor  32.68 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.39027  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5906  histidine utilization repressor  32.68 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3905  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 255 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4840  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  32.33 
 
 		 267 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.180839 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3722  histidine utilization repressor  33.17 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0708  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.89 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.583833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4641  histidine utilization repressor  33.17 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2221  histidine utilization repressor  31.2 
 
 		 255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2581  GntR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003719  histidine utilization repressor  29.82 
 
 		 235 aa  119  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.746481  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5462  histidine utilization repressor  30.57 
 
 		 231 aa  118  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5005  histidine utilization repressor  30.57 
 
 		 231 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3606  histidine utilization repressor  30.57 
 
 		 231 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2078  histidine utilization repressor  30.57 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3799  histidine utilization repressor  32.68 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5618  histidine utilization repressor  35.32 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.214724 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2386  histidine utilization repressor  32.2 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5835  histidine utilization repressor  34.58 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2932  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 228 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1823  histidine utilization repressor  31.47 
 
 		 267 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325999  normal  0.489419 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1166  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 261 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.448437  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>