More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2547 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2547  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  100 
 
 		 242 aa  494  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00724  histidine utilization repressor  62.82 
 
 		 234 aa  293  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0579746  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2358  histidine utilization repressor  50.63 
 
 		 244 aa  245  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1300  histidine utilization repressor  53.22 
 
 		 237 aa  244  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1656  histidine utilization repressor  55.17 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00445076  normal  0.818618 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6920  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  49.38 
 
 		 239 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6454  GntR family transcriptional regulator  50.86 
 
 		 245 aa  232  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1040  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  54.2 
 
 		 686 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5924  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  48.35 
 
 		 240 aa  224  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354183  normal  0.182633 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2988  histidine utilization repressor  47.72 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4635  GntR family transcriptional regulator  49.57 
 
 		 233 aa  218  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1438  GntR family transcriptional regulator  47.28 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0927  histidine utilization repressor  48.93 
 
 		 247 aa  216  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0869  histidine utilization repressor  48.93 
 
 		 247 aa  216  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.287597  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4638  transcriptional regulator, GntR family  42.13 
 
 		 247 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6444  transcriptional regulator, GntR family  41.88 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5963  transcriptional regulator GntR family  43.51 
 
 		 249 aa  180  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1606  histidine utilization repressor  41.67 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.971553  normal  0.693248 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1686  GntR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4087  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  45.64 
 
 		 195 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.489248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4219  GntR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2976  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 242 aa  155  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0845294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  33.9 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 255 aa  144  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0075  histidine utilization repressor  34.17 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4895  histidine utilization repressor  33.75 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1261  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  33.77 
 
 		 247 aa  141  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  33.75 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  33.75 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  36.24 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  33.75 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3642  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5445  histidine utilization repressor  33.33 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0118538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3001  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 217 aa  138  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.471781 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2647  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  33.48 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  34.33 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3229  histidine utilization repressor  33.47 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0358  histidine utilization repressor  31.6 
 
 		 249 aa  135  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.824022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2932  GntR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1576  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  38.6 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0273735  normal  0.277013 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4940  histidine utilization repressor  32 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5106  histidine utilization repressor  35.56 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0814369  hitchhiker  0.00493265 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2511  histidine utilization repressor  30.9 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0551986 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1262  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2112  histidine utilization repressor  30.9 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1044  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3644  histidine utilization repressor  34.93 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2221  histidine utilization repressor  30.47 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2946  histidine utilization repressor  33.49 
 
 		 231 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1165  histidine utilization repressor  33.63 
 
 		 236 aa  128  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0708  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.33 
 
 		 233 aa  128  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.583833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5049  histidine utilization repressor  31.74 
 
 		 251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00586645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0429  histidine utilization repressor  30.6 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.245315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5085  histidine utilization repressor  30.17 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4909  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3799  histidine utilization repressor  34.63 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0826  histidine utilization repressor  31.86 
 
 		 236 aa  125  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000366249  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2386  histidine utilization repressor  34.15 
 
 		 231 aa  124  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1531  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  33.02 
 
 		 231 aa  125  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.250236  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5035  histidine utilization repressor  30.17 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5172  histidine utilization repressor  30.3 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1166  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.448437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0704  histidine utilization repressor  28.76 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3722  histidine utilization repressor  34.15 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4641  histidine utilization repressor  34.15 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3583  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1813  histidine utilization repressor  32.38 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.167757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0148  histidine utilization repressor  30.13 
 
 		 262 aa  122  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0366  histidine utilization repressor  31.4 
 
 		 273 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67420  histidine utilization genes repressor protein  32.1 
 
 		 250 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5462  histidine utilization repressor  33.66 
 
 		 231 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4702  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 248 aa  122  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0392151  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3606  histidine utilization repressor  33.66 
 
 		 231 aa  121  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2078  histidine utilization repressor  29.87 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5838  histidine utilization repressor  32.23 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4839  histidine utilization repressor  34.84 
 
 		 233 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0895  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1823  histidine utilization repressor  34.2 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325999  normal  0.489419 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4559  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  31.47 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2188  histidine utilization repressor  32.69 
 
 		 231 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2171  histidine utilization repressor  32.69 
 
 		 231 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.39027  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5906  histidine utilization repressor  32.69 
 
 		 231 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5005  histidine utilization repressor  32.68 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4840  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  32.31 
 
 		 267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.180839 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1099  histidine utilization repressor  33.17 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1750  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0970545  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5481  histidine utilization repressor  32.69 
 
 		 231 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1294  histidine utilization repressor  32.49 
 
 		 244 aa  119  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5923  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  30.9 
 
 		 251 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113874 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4170  histidine utilization repressor  33.63 
 
 		 234 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2087  histidine utilization repressor  32.69 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2210  histidine utilization repressor  32.69 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6110  histidine utilization repressor  32.16 
 
 		 251 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5746  histidine utilization repressor  32.16 
 
 		 251 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6592  histidine utilization repressor  32.16 
 
 		 251 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal  0.101362 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6916  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  30.47 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5835  histidine utilization repressor  32.16 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4698  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1033  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family protein  29.73 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5618  histidine utilization repressor  32.31 
 
 		 251 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.214724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>