More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4702 on replicon NC_009671
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009671  Oant_4702  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
248 aa  509  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0392151  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4940  histidine utilization repressor  77.69 
 
 
254 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4698  GntR family transcriptional regulator  66.95 
 
 
253 aa  351  5.9999999999999994e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1166  GntR family transcriptional regulator  58.9 
 
 
261 aa  293  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.448437  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5172  histidine utilization repressor  41.3 
 
 
249 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0358  histidine utilization repressor  40.87 
 
 
249 aa  192  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.824022  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5035  histidine utilization repressor  41.74 
 
 
248 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5085  histidine utilization repressor  41.3 
 
 
248 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0366  histidine utilization repressor  41.3 
 
 
273 aa  190  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4909  GntR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
248 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0429  histidine utilization repressor  41.3 
 
 
248 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.245315  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1261  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  40.43 
 
 
247 aa  186  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2647  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  39.57 
 
 
251 aa  185  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5049  histidine utilization repressor  40.6 
 
 
251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00586645  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2087  histidine utilization repressor  41.07 
 
 
231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286639  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1680  histidine utilization repressor  41.96 
 
 
231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2210  histidine utilization repressor  41.07 
 
 
231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2920  histidine utilization repressor  41.96 
 
 
231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2795  histidine utilization repressor  41.52 
 
 
231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0646  histidine utilization repressor  41.52 
 
 
231 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2722  histidine utilization repressor  41.52 
 
 
231 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2365  histidine utilization repressor  41.52 
 
 
231 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366137  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2666  histidine utilization repressor  41.52 
 
 
231 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154672  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67420  histidine utilization genes repressor protein  41.07 
 
 
250 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5481  histidine utilization repressor  40.62 
 
 
231 aa  181  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571458  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5838  histidine utilization repressor  41.07 
 
 
250 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1821  histidine utilization repressor  41.52 
 
 
231 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1813  histidine utilization repressor  40.43 
 
 
234 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.167757 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2171  histidine utilization repressor  40.62 
 
 
231 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.39027  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5906  histidine utilization repressor  40.62 
 
 
231 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2188  histidine utilization repressor  40.62 
 
 
231 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1099  histidine utilization repressor  40.62 
 
 
231 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4559  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  40.87 
 
 
253 aa  178  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0505  histidine utilization repressor  40.26 
 
 
301 aa  178  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4641  histidine utilization repressor  40.62 
 
 
231 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3722  histidine utilization repressor  40.62 
 
 
231 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3799  histidine utilization repressor  40.62 
 
 
231 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1262  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
244 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3606  histidine utilization repressor  40.62 
 
 
231 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5462  histidine utilization repressor  40.62 
 
 
231 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0895  GntR family transcriptional regulator  42.41 
 
 
251 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2946  histidine utilization repressor  40.27 
 
 
231 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2386  histidine utilization repressor  40.62 
 
 
231 aa  175  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0081  histidine utilization repressor  42.15 
 
 
234 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1531  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  40.27 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.250236  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5005  histidine utilization repressor  39.29 
 
 
231 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0099  histidine utilization repressor  41.78 
 
 
235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0096  histidine utilization repressor  41.78 
 
 
235 aa  172  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3758  histidine utilization repressor  43.11 
 
 
235 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0153453 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0093  histidine utilization repressor  41.78 
 
 
235 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
255 aa  171  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4448  histidine utilization repressor  40.62 
 
 
233 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1750  GntR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
254 aa  171  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0970545  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2078  histidine utilization repressor  36.52 
 
 
251 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  38.86 
 
 
255 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0098  histidine utilization repressor  41.33 
 
 
235 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3954  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family protein  41.15 
 
 
247 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02076  hypothetical protein  37.28 
 
 
235 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0910  histidine utilization repressor  40.17 
 
 
245 aa  168  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0082  histidine utilization repressor  41.33 
 
 
235 aa  168  7e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2112  histidine utilization repressor  36.96 
 
 
255 aa  168  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2511  histidine utilization repressor  36.96 
 
 
255 aa  168  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0551986 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2221  histidine utilization repressor  36.96 
 
 
255 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003719  histidine utilization repressor  39.04 
 
 
235 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.746481  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0721  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  38.74 
 
 
237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274282  normal  0.4322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4253  histidine utilization repressor  41.41 
 
 
235 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4068  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
250 aa  165  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232008  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1033  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family protein  34.8 
 
 
234 aa  165  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0078  histidine utilization repressor  40.44 
 
 
235 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3905  GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2581  GntR family transcriptional regulator  37.05 
 
 
247 aa  164  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1294  histidine utilization repressor  39.22 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  37.12 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5923  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  37.02 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.113874 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0704  histidine utilization repressor  34.51 
 
 
234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0101  histidine utilization repressor  40.97 
 
 
235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0096  GntR family transcriptional regulator  40.97 
 
 
235 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0826  histidine utilization repressor  35.53 
 
 
236 aa  162  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000366249  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2882  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  36.36 
 
 
237 aa  161  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2476  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  36.36 
 
 
237 aa  161  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00699876  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6916  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  36.17 
 
 
251 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1165  histidine utilization repressor  39.5 
 
 
236 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1020  histidine utilization repressor  39.56 
 
 
244 aa  159  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2648  histidine utilization repressor transcription regulator protein  36.21 
 
 
237 aa  159  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186467  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4839  histidine utilization repressor  38.67 
 
 
233 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0825  histidine utilization repressor  38.82 
 
 
241 aa  158  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3583  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
256 aa  158  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0884  histidine utilization repressor  38.82 
 
 
241 aa  158  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0916  histidine utilization repressor  38.82 
 
 
241 aa  158  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0397561  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5105  histidine utilization repressor  37.05 
 
 
251 aa  158  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0431147  hitchhiker  0.00830494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0853  histidine utilization repressor  38.82 
 
 
241 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0148  histidine utilization repressor  36.89 
 
 
262 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0939  histidine utilization repressor  38.82 
 
 
241 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.997369  normal  0.595643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4839  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  37.05 
 
 
253 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.187571 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1824  GntR family transcriptional regulator  37.05 
 
 
227 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.484103 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5835  histidine utilization repressor  37.78 
 
 
251 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1044  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 
269 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5618  histidine utilization repressor  37.78 
 
 
251 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.214724 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6592  histidine utilization repressor  38.22 
 
 
251 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal  0.101362 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5746  histidine utilization repressor  38.22 
 
 
251 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>