More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2976 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2976  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  500  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0845294  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2988  histidine utilization repressor  37.73 
 
 		 241 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5924  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  38.18 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354183  normal  0.182633 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6920  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  36.32 
 
 		 239 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2547  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  37.29 
 
 		 242 aa  155  6e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1438  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1300  histidine utilization repressor  36.49 
 
 		 237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4219  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1656  histidine utilization repressor  37.45 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00445076  normal  0.818618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6454  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1606  histidine utilization repressor  36.24 
 
 		 244 aa  140  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.971553  normal  0.693248 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1686  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2358  histidine utilization repressor  35.29 
 
 		 244 aa  138  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0869  histidine utilization repressor  38.43 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.287597  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0927  histidine utilization repressor  38.43 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0148  histidine utilization repressor  34.36 
 
 		 262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00724  histidine utilization repressor  36.24 
 
 		 234 aa  135  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0579746  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4635  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  34.38 
 
 		 255 aa  128  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4638  transcriptional regulator, GntR family  31.36 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1040  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  38.22 
 
 		 686 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4087  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.57 
 
 		 195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.489248 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 255 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  33.04 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5963  transcriptional regulator GntR family  33.03 
 
 		 249 aa  122  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6444  transcriptional regulator, GntR family  32.41 
 
 		 234 aa  121  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3644  histidine utilization repressor  32.6 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4940  histidine utilization repressor  31.49 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0708  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.18 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.583833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  30.36 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5106  histidine utilization repressor  33.78 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0814369  hitchhiker  0.00493265 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4702  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 248 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0392151  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1165  histidine utilization repressor  33.19 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0366  histidine utilization repressor  31.17 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0910  histidine utilization repressor  30.23 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1033  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family protein  29.9 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3001  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 217 aa  112  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.471781 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0826  histidine utilization repressor  31.22 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000366249  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1261  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  29.96 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2087  histidine utilization repressor  31.25 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5049  histidine utilization repressor  31.14 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00586645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2210  histidine utilization repressor  31.25 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5172  histidine utilization repressor  30.59 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4698  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5004  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2647  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  28.63 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5005  histidine utilization repressor  29.46 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003719  histidine utilization repressor  27.63 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.746481  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5085  histidine utilization repressor  29.74 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6308  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1099  histidine utilization repressor  30.14 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2795  histidine utilization repressor  29.22 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1680  histidine utilization repressor  29.22 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4157  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497952  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1044  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 269 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2920  histidine utilization repressor  29.22 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4909  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2666  histidine utilization repressor  29.22 
 
 		 231 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154672  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0646  histidine utilization repressor  29.22 
 
 		 231 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2365  histidine utilization repressor  29.22 
 
 		 231 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366137  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2722  histidine utilization repressor  29.22 
 
 		 231 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0429  histidine utilization repressor  29.44 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.245315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5481  histidine utilization repressor  29.46 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5906  histidine utilization repressor  29.91 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2188  histidine utilization repressor  29.91 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2171  histidine utilization repressor  29.91 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.39027  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3642  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 233 aa  105  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3799  histidine utilization repressor  30.18 
 
 		 231 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4641  histidine utilization repressor  30.18 
 
 		 231 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3722  histidine utilization repressor  30.18 
 
 		 231 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67420  histidine utilization genes repressor protein  28.76 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5838  histidine utilization repressor  28.76 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5035  histidine utilization repressor  29.44 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0358  histidine utilization repressor  29.44 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.824022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2386  histidine utilization repressor  29.73 
 
 		 231 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1294  histidine utilization repressor  32.2 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1821  histidine utilization repressor  28.31 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  30.09 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  30.09 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1823  histidine utilization repressor  33.48 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325999  normal  0.489419 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4559  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  31.94 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  30.09 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0704  histidine utilization repressor  26.91 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3229  histidine utilization repressor  29.78 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259882 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2408  histidine utilization repressor  26.27 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.067403  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1262  GntR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5462  histidine utilization repressor  29.28 
 
 		 231 aa  101  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3606  histidine utilization repressor  29.02 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4840  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  33.04 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.180839 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2648  histidine utilization repressor transcription regulator protein  26.67 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2112  histidine utilization repressor  26.61 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2221  histidine utilization repressor  26.61 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2511  histidine utilization repressor  26.61 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0551986 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1750  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0970545  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1166  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.448437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0895  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 251 aa  99  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0081  histidine utilization repressor  29.05 
 
 		 234 aa  99  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3954  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family protein  28.07 
 
 		 247 aa  99  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02076  hypothetical protein  25.88 
 
 		 235 aa  98.6  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4895  histidine utilization repressor  30.33 
 
 		 245 aa  98.6  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>