More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6454 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6454  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  496  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1438  GntR family transcriptional regulator  52.59 
 
 		 248 aa  251  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1300  histidine utilization repressor  53.91 
 
 		 237 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2358  histidine utilization repressor  52.99 
 
 		 244 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2988  histidine utilization repressor  50.66 
 
 		 241 aa  244  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0927  histidine utilization repressor  52.79 
 
 		 247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0869  histidine utilization repressor  52.79 
 
 		 247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.287597  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6920  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  50.44 
 
 		 239 aa  239  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5924  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  50.88 
 
 		 240 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354183  normal  0.182633 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2547  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  50.86 
 
 		 242 aa  232  5e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1656  histidine utilization repressor  55.84 
 
 		 235 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00445076  normal  0.818618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4635  GntR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 233 aa  228  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00724  histidine utilization repressor  50.66 
 
 		 234 aa  223  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0579746  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1040  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  56.52 
 
 		 686 aa  221  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1606  histidine utilization repressor  44.16 
 
 		 244 aa  198  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.971553  normal  0.693248 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5963  transcriptional regulator GntR family  45.3 
 
 		 249 aa  195  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1686  GntR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 226 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4638  transcriptional regulator, GntR family  40.95 
 
 		 247 aa  191  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6444  transcriptional regulator, GntR family  41.74 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4087  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  48.68 
 
 		 195 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.489248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4219  GntR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0429  histidine utilization repressor  38.53 
 
 		 248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.245315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0358  histidine utilization repressor  37 
 
 		 249 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.824022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5085  histidine utilization repressor  38.1 
 
 		 248 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0366  histidine utilization repressor  37 
 
 		 273 aa  161  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4909  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5035  histidine utilization repressor  38.1 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5172  histidine utilization repressor  37 
 
 		 249 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5049  histidine utilization repressor  37.08 
 
 		 251 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00586645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67420  histidine utilization genes repressor protein  37.89 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5838  histidine utilization repressor  37.44 
 
 		 250 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  34.93 
 
 		 245 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0895  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 251 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  35.37 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  36.4 
 
 		 260 aa  148  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0939  histidine utilization repressor  33.89 
 
 		 241 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.997369  normal  0.595643 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0884  histidine utilization repressor  33.89 
 
 		 241 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0825  histidine utilization repressor  33.89 
 
 		 241 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0916  histidine utilization repressor  33.89 
 
 		 241 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0397561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0853  histidine utilization repressor  33.89 
 
 		 241 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4940  histidine utilization repressor  34.98 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3644  histidine utilization repressor  35.37 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2221  histidine utilization repressor  33.04 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1044  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 269 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0148  histidine utilization repressor  32.89 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2976  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0845294  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4702  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0392151  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2511  histidine utilization repressor  33.04 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0551986 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2112  histidine utilization repressor  33.04 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4895  histidine utilization repressor  32.75 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4698  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 253 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3229  histidine utilization repressor  33.19 
 
 		 245 aa  138  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259882 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1262  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0075  histidine utilization repressor  32.75 
 
 		 245 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1033  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family protein  31.53 
 
 		 234 aa  138  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0704  histidine utilization repressor  30.84 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3954  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family protein  33.77 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5445  histidine utilization repressor  32.31 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0118538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5106  histidine utilization repressor  35.4 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0814369  hitchhiker  0.00493265 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  32.31 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  32.31 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  32.31 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1261  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  31.72 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2581  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 247 aa  135  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6916  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  33.19 
 
 		 251 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0826  histidine utilization repressor  32.33 
 
 		 236 aa  134  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000366249  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0853  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.122159  hitchhiker  0.00270002 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003719  histidine utilization repressor  33.33 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.746481  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5923  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  32.77 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113874 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02076  hypothetical protein  32.31 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4840  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  34.51 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.180839 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3001  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 217 aa  132  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.471781 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3905  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0081  histidine utilization repressor  33.33 
 
 		 234 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2647  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  31.72 
 
 		 251 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1576  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  37.84 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0273735  normal  0.277013 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2932  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0505  histidine utilization repressor  34.65 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1294  histidine utilization repressor  34.04 
 
 		 244 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0708  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  35.48 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.583833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3758  histidine utilization repressor  31.98 
 
 		 235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0153453 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4839  histidine utilization repressor  31.98 
 
 		 233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2078  histidine utilization repressor  31.28 
 
 		 251 aa  128  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1823  histidine utilization repressor  33.63 
 
 		 267 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325999  normal  0.489419 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4448  histidine utilization repressor  32.88 
 
 		 233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1165  histidine utilization repressor  32.6 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4253  histidine utilization repressor  32.88 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4170  histidine utilization repressor  32.43 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0078  histidine utilization repressor  33.33 
 
 		 235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1821  histidine utilization repressor  30.97 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0082  histidine utilization repressor  31.17 
 
 		 235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3583  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0646  histidine utilization repressor  30.53 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2666  histidine utilization repressor  30.53 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154672  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2365  histidine utilization repressor  30.53 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366137  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2722  histidine utilization repressor  30.53 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2920  histidine utilization repressor  30.53 
 
 		 231 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1680  histidine utilization repressor  30.53 
 
 		 231 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4559  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  30.97 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>