More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6920 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6920  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  100 
 
 		 239 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5924  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  93.72 
 
 		 240 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354183  normal  0.182633 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2988  histidine utilization repressor  66.53 
 
 		 241 aa  337  8e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1438  GntR family transcriptional regulator  58.87 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0927  histidine utilization repressor  60.61 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0869  histidine utilization repressor  60.61 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.287597  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6454  GntR family transcriptional regulator  50.44 
 
 		 245 aa  239  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4087  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  57.51 
 
 		 195 aa  236  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.489248 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2547  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  49.38 
 
 		 242 aa  232  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5963  transcriptional regulator GntR family  53.19 
 
 		 249 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2358  histidine utilization repressor  47.26 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1656  histidine utilization repressor  50 
 
 		 235 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00445076  normal  0.818618 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1300  histidine utilization repressor  46.15 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4635  GntR family transcriptional regulator  48.02 
 
 		 233 aa  214  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1040  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  50.43 
 
 		 686 aa  210  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6444  transcriptional regulator, GntR family  42.92 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00724  histidine utilization repressor  46.55 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0579746  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4638  transcriptional regulator, GntR family  42.54 
 
 		 247 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1606  histidine utilization repressor  41.92 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.971553  normal  0.693248 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1686  GntR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  38.1 
 
 		 245 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0075  histidine utilization repressor  38.1 
 
 		 245 aa  164  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  38.1 
 
 		 245 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  38.1 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4219  GntR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3229  histidine utilization repressor  36.8 
 
 		 245 aa  158  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2976  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 242 aa  158  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0845294  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4895  histidine utilization repressor  36.36 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5445  histidine utilization repressor  36.36 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0118538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  35.47 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  37 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0366  histidine utilization repressor  33.47 
 
 		 273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5172  histidine utilization repressor  33.47 
 
 		 249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0358  histidine utilization repressor  33.19 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.824022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  36.12 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5106  histidine utilization repressor  36.84 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0814369  hitchhiker  0.00493265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4909  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5035  histidine utilization repressor  32.2 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0429  histidine utilization repressor  32.2 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.245315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5085  histidine utilization repressor  32.2 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1262  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 244 aa  141  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5838  histidine utilization repressor  33.33 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3644  histidine utilization repressor  35.68 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67420  histidine utilization genes repressor protein  32.89 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0704  histidine utilization repressor  31.11 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2408  histidine utilization repressor  32.33 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.067403  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5049  histidine utilization repressor  31.6 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00586645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4839  histidine utilization repressor  35 
 
 		 233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4840  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  35.53 
 
 		 267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.180839 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3001  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.471781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0895  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4559  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  34.07 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1033  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family protein  32.46 
 
 		 234 aa  132  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1823  histidine utilization repressor  35.09 
 
 		 267 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325999  normal  0.489419 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0826  histidine utilization repressor  34.93 
 
 		 236 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000366249  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4940  histidine utilization repressor  32.46 
 
 		 254 aa  132  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0082  histidine utilization repressor  33.18 
 
 		 235 aa  132  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4170  histidine utilization repressor  33.47 
 
 		 234 aa  131  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2112  histidine utilization repressor  30.57 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6916  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  32.3 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2511  histidine utilization repressor  30.57 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0551986 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1261  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  30.84 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1750  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0970545  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1165  histidine utilization repressor  36.07 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2221  histidine utilization repressor  30.57 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3954  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family protein  32.77 
 
 		 247 aa  129  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4702  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 248 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0392151  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4698  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 253 aa  128  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5923  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  32.56 
 
 		 251 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113874 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1044  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 269 aa  128  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0708  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.14 
 
 		 233 aa  128  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.583833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003719  histidine utilization repressor  31.58 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.746481  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2581  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2647  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  31.28 
 
 		 251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4448  histidine utilization repressor  32.73 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4068  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1166  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.448437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3758  histidine utilization repressor  33.05 
 
 		 235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0153453 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0101  histidine utilization repressor  32.48 
 
 		 235 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0078  histidine utilization repressor  31.51 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0825  histidine utilization repressor  29.96 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0916  histidine utilization repressor  29.96 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0397561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4253  histidine utilization repressor  32.48 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0939  histidine utilization repressor  29.96 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.997369  normal  0.595643 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0884  histidine utilization repressor  29.96 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0099  histidine utilization repressor  33.33 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0093  histidine utilization repressor  33.33 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0853  histidine utilization repressor  29.96 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0098  histidine utilization repressor  34.23 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02076  hypothetical protein  30.13 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0096  histidine utilization repressor  33.18 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1294  histidine utilization repressor  31.06 
 
 		 244 aa  122  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0081  histidine utilization repressor  31.94 
 
 		 234 aa  122  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2078  histidine utilization repressor  28.95 
 
 		 251 aa  121  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2946  histidine utilization repressor  30.53 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2795  histidine utilization repressor  30.09 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2722  histidine utilization repressor  30.09 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1929  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 260 aa  119  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2666  histidine utilization repressor  30.09 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>