More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2358 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2358  histidine utilization repressor  100 
 
 		 244 aa  496  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1300  histidine utilization repressor  60.7 
 
 		 237 aa  274  7e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2547  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  50.63 
 
 		 242 aa  245  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00724  histidine utilization repressor  52.81 
 
 		 234 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0579746  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6454  GntR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 245 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1438  GntR family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1656  histidine utilization repressor  56.52 
 
 		 235 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00445076  normal  0.818618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4635  GntR family transcriptional regulator  50.22 
 
 		 233 aa  231  8.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6920  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  47.26 
 
 		 239 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1040  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  56.71 
 
 		 686 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0927  histidine utilization repressor  47.5 
 
 		 247 aa  226  4e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0869  histidine utilization repressor  47.5 
 
 		 247 aa  226  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.287597  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2988  histidine utilization repressor  44.58 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5924  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  47.7 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354183  normal  0.182633 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6444  transcriptional regulator, GntR family  45.65 
 
 		 234 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4638  transcriptional regulator, GntR family  44.26 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1686  GntR family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 226 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1606  histidine utilization repressor  44.02 
 
 		 244 aa  195  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.971553  normal  0.693248 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5963  transcriptional regulator GntR family  44.83 
 
 		 249 aa  194  8.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4087  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  47.94 
 
 		 195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.489248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  41.84 
 
 		 245 aa  175  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1261  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  35.17 
 
 		 247 aa  166  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67420  histidine utilization genes repressor protein  36.6 
 
 		 250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4559  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  37.23 
 
 		 253 aa  162  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5838  histidine utilization repressor  36.17 
 
 		 250 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2511  histidine utilization repressor  34.18 
 
 		 255 aa  161  8.000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0551986 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2112  histidine utilization repressor  34.18 
 
 		 255 aa  161  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1262  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 244 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3905  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0895  GntR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 251 aa  158  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2221  histidine utilization repressor  33.76 
 
 		 255 aa  158  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  39.65 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3644  histidine utilization repressor  39.91 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5172  histidine utilization repressor  33.48 
 
 		 249 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2647  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  33.33 
 
 		 251 aa  155  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4219  GntR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 231 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2078  histidine utilization repressor  33.76 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0366  histidine utilization repressor  33.48 
 
 		 273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0429  histidine utilization repressor  33.61 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.245315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5049  histidine utilization repressor  35.29 
 
 		 251 aa  154  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00586645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3229  histidine utilization repressor  39.13 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259882 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4895  histidine utilization repressor  38.26 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5035  histidine utilization repressor  33.19 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5085  histidine utilization repressor  33.19 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0358  histidine utilization repressor  32.76 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.824022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0075  histidine utilization repressor  38.43 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  36.36 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4909  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  38.7 
 
 		 245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  38.7 
 
 		 245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5445  histidine utilization repressor  37.83 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0118538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0148  histidine utilization repressor  36.02 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  37.55 
 
 		 245 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3583  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0939  histidine utilization repressor  32.48 
 
 		 241 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.997369  normal  0.595643 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0884  histidine utilization repressor  32.48 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0916  histidine utilization repressor  32.48 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0397561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0825  histidine utilization repressor  32.48 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0853  histidine utilization repressor  32.48 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1044  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0704  histidine utilization repressor  32.89 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4840  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  37.28 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.180839 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1166  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 261 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.448437  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0910  histidine utilization repressor  33.76 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1823  histidine utilization repressor  36.84 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325999  normal  0.489419 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4068  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4940  histidine utilization repressor  32.4 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5106  histidine utilization repressor  37.61 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0814369  hitchhiker  0.00493265 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2976  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 242 aa  138  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0845294  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1033  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family protein  34.09 
 
 		 234 aa  138  8.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2581  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0826  histidine utilization repressor  34.07 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000366249  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3001  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.471781 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1294  histidine utilization repressor  35.59 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02076  hypothetical protein  33.62 
 
 		 235 aa  134  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5923  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  31.36 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113874 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1750  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0970545  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6916  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  31.36 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4698  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2171  histidine utilization repressor  32.13 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.39027  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5906  histidine utilization repressor  32.13 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2188  histidine utilization repressor  32.13 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0082  histidine utilization repressor  33.04 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003719  histidine utilization repressor  32.75 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.746481  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2087  histidine utilization repressor  32.13 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2210  histidine utilization repressor  32.13 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1165  histidine utilization repressor  34.2 
 
 		 236 aa  128  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4702  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 248 aa  128  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0392151  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5481  histidine utilization repressor  31.67 
 
 		 231 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1099  histidine utilization repressor  31.22 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1813  histidine utilization repressor  33.64 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.167757 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0505  histidine utilization repressor  32.44 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6308  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5005  histidine utilization repressor  33.94 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2946  histidine utilization repressor  32.73 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1020  histidine utilization repressor  30.94 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2408  histidine utilization repressor  32.14 
 
 		 266 aa  126  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.067403  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1531  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  32.73 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.250236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4839  histidine utilization repressor  32.59 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>