More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1040 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1040  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  100 
 
 		 686 aa  1314    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1655  N-formimino-L-glutamate deiminase  78.8 
 
 		 457 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0258161  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6453  N-formimino-L-glutamate deiminase  64.26 
 
 		 452 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.939265 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1656  histidine utilization repressor  83.4 
 
 		 235 aa  365  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00445076  normal  0.818618 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1687  N-formimino-L-glutamate deiminase  64.86 
 
 		 449 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2548  N-formimino-L-glutamate deiminase  62.9 
 
 		 456 aa  354  4e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5960  N-formimino-L-glutamate deiminase  60.29 
 
 		 449 aa  349  9e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1299  N-formimino-L-glutamate deiminase  66.55 
 
 		 491 aa  347  5e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0928  N-formimino-L-glutamate deiminase  61.62 
 
 		 454 aa  341  2.9999999999999998e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0870  N-formimino-L-glutamate deiminase  61.62 
 
 		 454 aa  341  2.9999999999999998e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4634  N-formimino-L-glutamate deiminase  64.21 
 
 		 452 aa  341  2.9999999999999998e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2987  N-formimino-L-glutamate deiminase  61.11 
 
 		 450 aa  339  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6921  N-formimino-L-glutamate deiminase  60.65 
 
 		 448 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772055  normal  0.983522 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5925  N-formimino-L-glutamate deiminase  60.29 
 
 		 448 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  0.12966 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1437  N-formimino-L-glutamate deiminase  59.11 
 
 		 455 aa  333  9e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00725  N-formimino-L-glutamate deiminase  60.51 
 
 		 456 aa  330  4e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0531221  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1605  N-formimino-L-glutamate deiminase  59.93 
 
 		 457 aa  330  5.0000000000000004e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.544919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3003  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.6 
 
 		 454 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0428  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.36 
 
 		 454 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2582  N-formimino-L-glutamate deiminase  57.71 
 
 		 457 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.213363 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0709  N-formimino-L-glutamate deiminase  54.64 
 
 		 453 aa  281  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1577  N-formimino-L-glutamate deiminase  58.61 
 
 		 455 aa  281  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0446865  normal  0.202401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4910  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.92 
 
 		 454 aa  281  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.508756 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5839  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.01 
 
 		 466 aa  280  7e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5036  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.55 
 
 		 454 aa  280  8e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5171  Atz/Trz family protein  49.46 
 
 		 454 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0367  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.82 
 
 		 454 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5086  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.92 
 
 		 454 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0357  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.75 
 
 		 454 aa  278  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2851  N-formimino-L-glutamate deiminase  54.26 
 
 		 469 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1745  N-formimino-L-glutamate deiminase  58.57 
 
 		 456 aa  274  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00942929  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4560  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.58 
 
 		 455 aa  273  9e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4352  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.64 
 
 		 464 aa  271  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67440  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.18 
 
 		 453 aa  270  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2510  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.79 
 
 		 456 aa  269  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2220  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.79 
 
 		 456 aa  269  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2111  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.79 
 
 		 456 aa  269  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.365467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2079  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.74 
 
 		 456 aa  268  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2933  N-formimino-L-glutamate deiminase  56.57 
 
 		 459 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0165  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.49 
 
 		 469 aa  266  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3903  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.6 
 
 		 466 aa  265  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2960  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.42 
 
 		 473 aa  263  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125073  normal  0.754686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2942  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.54 
 
 		 475 aa  263  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2712  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.05 
 
 		 468 aa  259  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.898098  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1302  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.28 
 
 		 455 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1853  formiminoglutamate deiminase  51.92 
 
 		 487 aa  258  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1535  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.04 
 
 		 468 aa  258  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1034  N-formimino-L-glutamate deiminase  48 
 
 		 483 aa  256  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0932501 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0155  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.71 
 
 		 466 aa  254  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3649  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.35 
 
 		 477 aa  254  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0243931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2547  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  54.2 
 
 		 242 aa  250  6e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5477  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.8 
 
 		 462 aa  249  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1103  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.64 
 
 		 458 aa  249  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1809  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.07 
 
 		 476 aa  249  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665973  normal  0.477845 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5910  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.14 
 
 		 458 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2167  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.14 
 
 		 458 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2358  histidine utilization repressor  56.71 
 
 		 244 aa  249  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2083  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.8 
 
 		 458 aa  249  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.756392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26300  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.26 
 
 		 462 aa  248  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.670476  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2184  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.8 
 
 		 458 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2206  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.45 
 
 		 458 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6454  GntR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 245 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1438  GntR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 248 aa  244  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00724  histidine utilization repressor  54.98 
 
 		 234 aa  243  7.999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0579746  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2654  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.53 
 
 		 454 aa  243  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5924  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  52.14 
 
 		 240 aa  240  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354183  normal  0.182633 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2662  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.38 
 
 		 460 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2791  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.38 
 
 		 460 aa  240  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2924  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.95 
 
 		 460 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0650  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.95 
 
 		 460 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1676  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.95 
 
 		 460 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2718  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.95 
 
 		 460 aa  238  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2361  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.95 
 
 		 460 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1254  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.56 
 
 		 454 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6920  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  50.43 
 
 		 239 aa  236  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1825  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.2 
 
 		 460 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256581  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0927  histidine utilization repressor  53.02 
 
 		 247 aa  233  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1300  histidine utilization repressor  54.74 
 
 		 237 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4635  GntR family transcriptional regulator  54.51 
 
 		 233 aa  232  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0869  histidine utilization repressor  53.02 
 
 		 247 aa  233  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.287597  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2988  histidine utilization repressor  49.35 
 
 		 241 aa  231  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4154  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.26 
 
 		 474 aa  207  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4638  transcriptional regulator, GntR family  45.41 
 
 		 247 aa  204  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5963  transcriptional regulator GntR family  47.01 
 
 		 249 aa  200  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6444  transcriptional regulator, GntR family  45.65 
 
 		 234 aa  200  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1686  GntR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 226 aa  196  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1606  histidine utilization repressor  44.25 
 
 		 244 aa  186  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.971553  normal  0.693248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2998  formiminoglutamate deiminase  45.94 
 
 		 512 aa  169  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0569  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.96 
 
 		 465 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172488  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0251  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.77 
 
 		 477 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4087  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  45.55 
 
 		 195 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.489248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0965  formiminoglutamate deiminase  39.29 
 
 		 446 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438421  normal  0.190111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5775  formiminoglutamate deiminase  41.22 
 
 		 453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0596  N-formimino-L-glutamate deiminase  42.86 
 
 		 465 aa  164  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0039  formiminoglutamate deiminase  42.86 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0604  N-formimino-L-glutamate deiminase  42.96 
 
 		 465 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1780  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.86 
 
 		 452 aa  157  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  39.65 
 
 		 245 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0584  N-formimino-L-glutamate deiminase  42.4 
 
 		 420 aa  154  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0612  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.3 
 
 		 446 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00720471  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>