More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1034 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1034  N-formimino-L-glutamate deiminase  100 
 
 		 483 aa  974    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0932501 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0165  N-formimino-L-glutamate deiminase  73.14 
 
 		 469 aa  649    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2960  N-formimino-L-glutamate deiminase  72.94 
 
 		 473 aa  636    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125073  normal  0.754686 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3649  N-formimino-L-glutamate deiminase  69.25 
 
 		 477 aa  629  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0243931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0155  N-formimino-L-glutamate deiminase  71.12 
 
 		 466 aa  629  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2712  N-formimino-L-glutamate deiminase  62.23 
 
 		 468 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.898098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2851  N-formimino-L-glutamate deiminase  62.42 
 
 		 469 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1809  N-formimino-L-glutamate deiminase  57.69 
 
 		 476 aa  498  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665973  normal  0.477845 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2942  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.95 
 
 		 475 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1535  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.41 
 
 		 468 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2083  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.53 
 
 		 458 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.756392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5477  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.22 
 
 		 462 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2206  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.1 
 
 		 458 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2184  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.88 
 
 		 458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5910  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.88 
 
 		 458 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2167  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.88 
 
 		 458 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1103  N-formimino-L-glutamate deiminase  56.11 
 
 		 458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1825  N-formimino-L-glutamate deiminase  55 
 
 		 460 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256581  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2718  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.1 
 
 		 460 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0650  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.1 
 
 		 460 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2791  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.1 
 
 		 460 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0357  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.72 
 
 		 454 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1676  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.1 
 
 		 460 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2924  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.1 
 
 		 460 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2662  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.1 
 
 		 460 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2361  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.1 
 
 		 460 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5171  Atz/Trz family protein  51.07 
 
 		 454 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5036  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.4 
 
 		 454 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5839  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.73 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67440  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.19 
 
 		 453 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0428  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.4 
 
 		 454 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4560  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.57 
 
 		 455 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2079  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.22 
 
 		 456 aa  418  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0367  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.21 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4910  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.54 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.508756 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1299  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.48 
 
 		 491 aa  402  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5086  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.11 
 
 		 454 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2548  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.32 
 
 		 456 aa  403  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0870  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.89 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0928  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.89 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5925  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.22 
 
 		 448 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  0.12966 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5960  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.4 
 
 		 449 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6453  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.35 
 
 		 452 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.939265 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1437  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.11 
 
 		 455 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4634  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.25 
 
 		 452 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1302  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.89 
 
 		 455 aa  398  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26300  N-formimino-L-glutamate deiminase  51 
 
 		 462 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.670476  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1254  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.39 
 
 		 454 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6921  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.6 
 
 		 448 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772055  normal  0.983522 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2220  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.51 
 
 		 456 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4352  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.82 
 
 		 464 aa  386  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1853  formiminoglutamate deiminase  47.36 
 
 		 487 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2510  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.72 
 
 		 456 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2111  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.72 
 
 		 456 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.365467  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3903  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.56 
 
 		 466 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2654  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.72 
 
 		 454 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2582  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.56 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.213363 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00725  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.03 
 
 		 456 aa  375  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0531221  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2987  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.3 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1655  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.45 
 
 		 457 aa  372  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0258161  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1687  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.55 
 
 		 449 aa  362  1e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1605  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.48 
 
 		 457 aa  358  8e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.544919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3003  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.28 
 
 		 454 aa  355  8.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4154  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.62 
 
 		 474 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0709  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.35 
 
 		 453 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1577  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.33 
 
 		 455 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0446865  normal  0.202401 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1745  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.09 
 
 		 456 aa  296  6e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00942929  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2933  N-formimino-L-glutamate deiminase  41.25 
 
 		 459 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1040  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  48 
 
 		 686 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0596  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.12 
 
 		 465 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0569  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.89 
 
 		 465 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172488  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5775  formiminoglutamate deiminase  36.63 
 
 		 453 aa  217  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0604  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.89 
 
 		 465 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0251  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.18 
 
 		 477 aa  200  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0584  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.04 
 
 		 420 aa  196  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1108  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.78 
 
 		 452 aa  196  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0998  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.76 
 
 		 452 aa  194  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.648434  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1780  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.75 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0039  formiminoglutamate deiminase  38.25 
 
 		 439 aa  187  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0965  formiminoglutamate deiminase  37.21 
 
 		 446 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438421  normal  0.190111 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4451  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.35 
 
 		 439 aa  184  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4386  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.66 
 
 		 430 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3616  formiminoglutamate deiminase  36.78 
 
 		 452 aa  177  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0953492  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6263  formiminoglutamate deiminase  36.69 
 
 		 429 aa  176  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0612  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.38 
 
 		 446 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00720471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2998  formiminoglutamate deiminase  37.08 
 
 		 512 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3639  amidohydrolase  35.94 
 
 		 394 aa  166  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0895387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1413  amidohydrolase  34.44 
 
 		 436 aa  159  9e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467624  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1148  amidohydrolase  28.51 
 
 		 481 aa  127  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1111  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.57 
 
 		 458 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3248  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.68 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3024  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.85 
 
 		 452 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  25.56 
 
 		 462 aa  89  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1915  amidohydrolase  26.29 
 
 		 421 aa  88.2  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232567  normal  0.102109 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  29.27 
 
 		 451 aa  87.8  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.65 
 
 		 470 aa  87  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1486  amidohydrolase  25.24 
 
 		 435 aa  87  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1786  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.84 
 
 		 450 aa  87  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.37 
 
 		 470 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3205  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.86 
 
 		 461 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>