More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1577 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2933  N-formimino-L-glutamate deiminase  91.72 
 
 
459 aa  753    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1577  N-formimino-L-glutamate deiminase  100 
 
 
455 aa  896    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0446865  normal  0.202401 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0709  N-formimino-L-glutamate deiminase  59.07 
 
 
453 aa  523  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361558  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3003  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.66 
 
 
454 aa  467  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1605  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.56 
 
 
457 aa  435  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.544919  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5925  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.97 
 
 
448 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  0.12966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1299  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.03 
 
 
491 aa  428  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0928  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.44 
 
 
454 aa  422  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0870  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.44 
 
 
454 aa  422  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2987  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.77 
 
 
450 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6921  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.53 
 
 
448 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772055  normal  0.983522 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2548  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.39 
 
 
456 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5960  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.66 
 
 
449 aa  418  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1437  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.22 
 
 
455 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1655  N-formimino-L-glutamate deiminase  57.14 
 
 
457 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0258161  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00725  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.77 
 
 
456 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0531221  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6453  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.1 
 
 
452 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.939265 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4634  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.36 
 
 
452 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0428  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.37 
 
 
454 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179062  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1687  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.48 
 
 
449 aa  378  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5839  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.14 
 
 
466 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5036  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.36 
 
 
454 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0357  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.93 
 
 
454 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4560  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.37 
 
 
455 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67440  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.67 
 
 
453 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5171  Atz/Trz family protein  46.41 
 
 
454 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1302  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.25 
 
 
455 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2582  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.88 
 
 
457 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.213363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1853  formiminoglutamate deiminase  48.97 
 
 
487 aa  365  1e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2510  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.54 
 
 
456 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2111  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.54 
 
 
456 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.365467  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2942  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.54 
 
 
475 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4352  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.07 
 
 
464 aa  357  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2220  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.31 
 
 
456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5086  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.8 
 
 
454 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2079  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.57 
 
 
456 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4910  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.25 
 
 
454 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.508756 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1745  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.87 
 
 
456 aa  352  7e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00942929  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1825  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.26 
 
 
460 aa  352  7e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256581  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2960  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.32 
 
 
473 aa  352  8.999999999999999e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125073  normal  0.754686 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1254  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.29 
 
 
454 aa  352  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26300  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.01 
 
 
462 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.670476  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2851  N-formimino-L-glutamate deiminase  47 
 
 
469 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0165  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.66 
 
 
469 aa  350  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1809  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.71 
 
 
476 aa  350  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665973  normal  0.477845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0155  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.75 
 
 
466 aa  348  9e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0367  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.06 
 
 
454 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5477  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.83 
 
 
462 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2083  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.37 
 
 
458 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.756392  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2712  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.19 
 
 
468 aa  346  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.898098  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3649  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.75 
 
 
477 aa  344  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0243931  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2206  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.27 
 
 
458 aa  342  8e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1535  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.78 
 
 
468 aa  342  8e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5910  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.91 
 
 
458 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2184  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.91 
 
 
458 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389835  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2167  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.91 
 
 
458 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1034  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.89 
 
 
483 aa  340  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0932501 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3903  N-formimino-L-glutamate deiminase  40.31 
 
 
466 aa  339  5e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.456692  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1103  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.68 
 
 
458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271378  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2654  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.72 
 
 
454 aa  332  9e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2718  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.06 
 
 
460 aa  332  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0650  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.06 
 
 
460 aa  332  9e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1676  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.06 
 
 
460 aa  332  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2924  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.06 
 
 
460 aa  332  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2361  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.06 
 
 
460 aa  332  9e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2791  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.83 
 
 
460 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2662  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.06 
 
 
460 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4154  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.47 
 
 
474 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1040  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  58.61 
 
 
686 aa  293  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5775  formiminoglutamate deiminase  35.75 
 
 
453 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1780  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.09 
 
 
452 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0965  formiminoglutamate deiminase  36.32 
 
 
446 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438421  normal  0.190111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3616  formiminoglutamate deiminase  35.55 
 
 
452 aa  199  9e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0953492  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0569  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.64 
 
 
465 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172488  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0604  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.67 
 
 
465 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0596  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.67 
 
 
465 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1108  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.13 
 
 
452 aa  186  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0998  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.66 
 
 
452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.648434  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0251  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.41 
 
 
477 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3639  amidohydrolase  38.29 
 
 
394 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0895387  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0039  formiminoglutamate deiminase  35.1 
 
 
439 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1413  amidohydrolase  35.2 
 
 
436 aa  176  6e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467624  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0612  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.62 
 
 
446 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00720471  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0584  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.37 
 
 
420 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6263  formiminoglutamate deiminase  36.41 
 
 
429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2998  formiminoglutamate deiminase  35.9 
 
 
512 aa  160  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4451  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.83 
 
 
439 aa  146  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4386  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.94 
 
 
430 aa  143  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1148  amidohydrolase  26.54 
 
 
481 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0911  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.78 
 
 
442 aa  87.4  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.6 
 
 
470 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1234  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.05 
 
 
446 aa  85.5  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.324176 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.99 
 
 
447 aa  84.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2773  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.17 
 
 
446 aa  83.6  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1906  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.52 
 
 
446 aa  83.2  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  30.74 
 
 
440 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.31 
 
 
469 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.84 
 
 
451 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0845  amidohydrolase  28.84 
 
 
503 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.664747  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.9 
 
 
451 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>