More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2083 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2184  N-formimino-L-glutamate deiminase  95.63 
 
 		 458 aa  866    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389835  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0650  N-formimino-L-glutamate deiminase  79.74 
 
 		 460 aa  697    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2791  N-formimino-L-glutamate deiminase  79.52 
 
 		 460 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5477  N-formimino-L-glutamate deiminase  94.76 
 
 		 462 aa  882    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1825  N-formimino-L-glutamate deiminase  81.64 
 
 		 460 aa  739    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256581  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1809  N-formimino-L-glutamate deiminase  73.45 
 
 		 476 aa  681    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665973  normal  0.477845 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1676  N-formimino-L-glutamate deiminase  79.74 
 
 		 460 aa  697    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2942  N-formimino-L-glutamate deiminase  71.21 
 
 		 475 aa  667    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5910  N-formimino-L-glutamate deiminase  95.85 
 
 		 458 aa  868    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2662  N-formimino-L-glutamate deiminase  79.74 
 
 		 460 aa  697    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1103  N-formimino-L-glutamate deiminase  94.1 
 
 		 458 aa  853    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2206  N-formimino-L-glutamate deiminase  98.91 
 
 		 458 aa  912    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2167  N-formimino-L-glutamate deiminase  95.85 
 
 		 458 aa  868    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2718  N-formimino-L-glutamate deiminase  79.74 
 
 		 460 aa  697    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2083  N-formimino-L-glutamate deiminase  100 
 
 		 458 aa  922    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.756392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2361  N-formimino-L-glutamate deiminase  79.74 
 
 		 460 aa  697    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2924  N-formimino-L-glutamate deiminase  79.74 
 
 		 460 aa  697    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1535  N-formimino-L-glutamate deiminase  70.72 
 
 		 468 aa  666    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2712  N-formimino-L-glutamate deiminase  56.1 
 
 		 468 aa  478  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.898098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2851  N-formimino-L-glutamate deiminase  57.23 
 
 		 469 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1034  N-formimino-L-glutamate deiminase  56.43 
 
 		 483 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0932501 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0155  N-formimino-L-glutamate deiminase  58.35 
 
 		 466 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0357  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.65 
 
 		 454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0165  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.28 
 
 		 469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2960  N-formimino-L-glutamate deiminase  56.06 
 
 		 473 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125073  normal  0.754686 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0428  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.22 
 
 		 454 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179062  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5171  Atz/Trz family protein  52.43 
 
 		 454 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5036  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.55 
 
 		 454 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67440  N-formimino-L-glutamate deiminase  54.08 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3649  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.89 
 
 		 477 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0243931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2079  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.42 
 
 		 456 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2220  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.99 
 
 		 456 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2510  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.22 
 
 		 456 aa  420  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5839  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.42 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2111  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.22 
 
 		 456 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.365467  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0367  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.88 
 
 		 454 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5086  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.99 
 
 		 454 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4910  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.77 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.508756 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4352  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.23 
 
 		 464 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4560  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.78 
 
 		 455 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3903  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.49 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26300  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.11 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.670476  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1299  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.64 
 
 		 491 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6453  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.11 
 
 		 452 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.939265 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1605  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.26 
 
 		 457 aa  386  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.544919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1254  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.65 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1853  formiminoglutamate deiminase  48.57 
 
 		 487 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0870  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.83 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0928  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.83 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2548  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.34 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2654  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.8 
 
 		 454 aa  364  1e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2582  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.45 
 
 		 457 aa  362  6e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.213363 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1437  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.47 
 
 		 455 aa  359  6e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1302  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.15 
 
 		 455 aa  359  7e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2987  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.27 
 
 		 450 aa  358  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1687  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.28 
 
 		 449 aa  354  2e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5925  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.39 
 
 		 448 aa  353  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  0.12966 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6921  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.51 
 
 		 448 aa  352  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772055  normal  0.983522 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5960  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.44 
 
 		 449 aa  352  8e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00725  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.16 
 
 		 456 aa  348  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0531221  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1655  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.75 
 
 		 457 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0258161  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4634  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.96 
 
 		 452 aa  345  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3003  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.15 
 
 		 454 aa  340  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0709  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.42 
 
 		 453 aa  338  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4154  N-formimino-L-glutamate deiminase  42.63 
 
 		 474 aa  310  4e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1577  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.37 
 
 		 455 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0446865  normal  0.202401 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1745  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.37 
 
 		 456 aa  296  4e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00942929  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2933  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.98 
 
 		 459 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1040  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  48.8 
 
 		 686 aa  246  8e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0569  N-formimino-L-glutamate deiminase  40.87 
 
 		 465 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172488  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0596  N-formimino-L-glutamate deiminase  40.62 
 
 		 465 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5775  formiminoglutamate deiminase  35.87 
 
 		 453 aa  219  8.999999999999998e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0604  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.74 
 
 		 465 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1780  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.78 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0612  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.06 
 
 		 446 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00720471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0039  formiminoglutamate deiminase  36.84 
 
 		 439 aa  194  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1108  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.47 
 
 		 452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0584  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.61 
 
 		 420 aa  190  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0965  formiminoglutamate deiminase  35.31 
 
 		 446 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438421  normal  0.190111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0998  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.23 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.648434  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0251  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.33 
 
 		 477 aa  182  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4451  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.73 
 
 		 439 aa  180  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3616  formiminoglutamate deiminase  33.7 
 
 		 452 aa  177  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0953492  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4386  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.02 
 
 		 430 aa  177  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3639  amidohydrolase  36.05 
 
 		 394 aa  172  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0895387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6263  formiminoglutamate deiminase  36.47 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2998  formiminoglutamate deiminase  39.02 
 
 		 512 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1413  amidohydrolase  35.62 
 
 		 436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467624  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1148  amidohydrolase  25.22 
 
 		 481 aa  113  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1786  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.81 
 
 		 450 aa  95.1  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1262  amidohydrolase  26.85 
 
 		 453 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2224  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.59 
 
 		 459 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.890081  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3129  amidohydrolase  26.75 
 
 		 434 aa  89.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.611034  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  26.34 
 
 		 432 aa  89.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2144  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.35 
 
 		 455 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0767906  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1111  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.46 
 
 		 458 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  25.75 
 
 		 435 aa  87  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3024  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.49 
 
 		 452 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883439  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  25.75 
 
 		 435 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  25.32 
 
 		 441 aa  86.7  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>