More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0965 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0965  formiminoglutamate deiminase  100 
 
 
446 aa  887    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438421  normal  0.190111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1780  N-formimino-L-glutamate deiminase  69.84 
 
 
452 aa  619  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0251  N-formimino-L-glutamate deiminase  59.77 
 
 
477 aa  498  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3616  formiminoglutamate deiminase  58.92 
 
 
452 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0953492  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0998  N-formimino-L-glutamate deiminase  56.17 
 
 
452 aa  413  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.648434  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1108  N-formimino-L-glutamate deiminase  58.06 
 
 
452 aa  411  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0039  formiminoglutamate deiminase  56.18 
 
 
439 aa  411  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5775  formiminoglutamate deiminase  51.96 
 
 
453 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4386  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.81 
 
 
430 aa  362  8e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2998  formiminoglutamate deiminase  53.25 
 
 
512 aa  361  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6263  formiminoglutamate deiminase  53.15 
 
 
429 aa  355  7.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4451  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.31 
 
 
439 aa  320  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0569  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.93 
 
 
465 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172488  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0596  N-formimino-L-glutamate deiminase  42.62 
 
 
465 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0604  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.46 
 
 
465 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0612  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.43 
 
 
446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00720471  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1413  amidohydrolase  40.33 
 
 
436 aa  241  2e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467624  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0584  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.07 
 
 
420 aa  225  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1302  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.98 
 
 
455 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3639  amidohydrolase  40.58 
 
 
394 aa  216  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0895387  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0357  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.03 
 
 
454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00725  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.43 
 
 
456 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0531221  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5036  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.35 
 
 
454 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4560  N-formimino-L-glutamate deiminase  32.96 
 
 
455 aa  209  7e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1853  formiminoglutamate deiminase  36.95 
 
 
487 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0428  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.31 
 
 
454 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179062  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1655  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.51 
 
 
457 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0258161  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4910  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.43 
 
 
454 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.508756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5086  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.85 
 
 
454 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0155  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.16 
 
 
466 aa  202  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67440  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.09 
 
 
453 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1687  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.86 
 
 
449 aa  199  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5839  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.54 
 
 
466 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2851  N-formimino-L-glutamate deiminase  37 
 
 
469 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2548  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.74 
 
 
456 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4154  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.56 
 
 
474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3003  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.76 
 
 
454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2079  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.41 
 
 
456 aa  196  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0709  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.73 
 
 
453 aa  196  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361558  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1605  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.85 
 
 
457 aa  196  9e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.544919  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5171  Atz/Trz family protein  32.35 
 
 
454 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2083  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.6 
 
 
458 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.756392  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1254  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.71 
 
 
454 aa  194  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6453  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.42 
 
 
452 aa  193  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.939265 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2206  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.37 
 
 
458 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0928  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.38 
 
 
454 aa  193  6e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0870  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.38 
 
 
454 aa  193  6e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1577  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.32 
 
 
455 aa  193  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0446865  normal  0.202401 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4634  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.29 
 
 
452 aa  192  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5910  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.62 
 
 
458 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2167  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.62 
 
 
458 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2220  N-formimino-L-glutamate deiminase  30.82 
 
 
456 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1299  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.7 
 
 
491 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2510  N-formimino-L-glutamate deiminase  30.59 
 
 
456 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2184  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.39 
 
 
458 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389835  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2111  N-formimino-L-glutamate deiminase  30.59 
 
 
456 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.365467  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2712  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.42 
 
 
468 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.898098  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1103  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.47 
 
 
458 aa  190  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271378  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5477  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.07 
 
 
462 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0367  N-formimino-L-glutamate deiminase  32.12 
 
 
454 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1825  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.62 
 
 
460 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256581  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6921  N-formimino-L-glutamate deiminase  35 
 
 
448 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772055  normal  0.983522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26300  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.39 
 
 
462 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.670476  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1535  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.89 
 
 
468 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2960  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.73 
 
 
473 aa  186  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125073  normal  0.754686 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1809  N-formimino-L-glutamate deiminase  32.21 
 
 
476 aa  186  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665973  normal  0.477845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1034  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.87 
 
 
483 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0932501 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5925  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.43 
 
 
448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  0.12966 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3903  N-formimino-L-glutamate deiminase  29.43 
 
 
466 aa  184  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.456692  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0650  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.04 
 
 
460 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1676  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.04 
 
 
460 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2924  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.04 
 
 
460 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2718  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.04 
 
 
460 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2361  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.04 
 
 
460 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2942  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.26 
 
 
475 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3649  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.44 
 
 
477 aa  182  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0243931  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2662  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.75 
 
 
460 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2791  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.75 
 
 
460 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5960  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.41 
 
 
449 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4352  N-formimino-L-glutamate deiminase  30.21 
 
 
464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2987  N-formimino-L-glutamate deiminase  32.61 
 
 
450 aa  180  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2654  N-formimino-L-glutamate deiminase  32.96 
 
 
454 aa  180  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2582  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.07 
 
 
457 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.213363 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0165  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.85 
 
 
469 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2933  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.7 
 
 
459 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1437  N-formimino-L-glutamate deiminase  32.24 
 
 
455 aa  173  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1148  amidohydrolase  31.6 
 
 
481 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1745  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.23 
 
 
456 aa  167  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00942929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1040  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  39.29 
 
 
686 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  32.7 
 
 
449 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31.55 
 
 
449 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3248  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  32.49 
 
 
452 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3425  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  32.4 
 
 
454 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.507053  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.43 
 
 
451 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1697  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.77 
 
 
454 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2144  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  32.07 
 
 
455 aa  134  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0767906  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.43 
 
 
452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2016  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.54 
 
 
454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  28.81 
 
 
445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3705  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.65 
 
 
451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>