More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5960 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5960  N-formimino-L-glutamate deiminase  100 
 
 		 449 aa  918    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6921  N-formimino-L-glutamate deiminase  66.89 
 
 		 448 aa  617  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772055  normal  0.983522 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5925  N-formimino-L-glutamate deiminase  66.29 
 
 		 448 aa  609  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  0.12966 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1437  N-formimino-L-glutamate deiminase  65.39 
 
 		 455 aa  590  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2987  N-formimino-L-glutamate deiminase  64.35 
 
 		 450 aa  585  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0928  N-formimino-L-glutamate deiminase  65.17 
 
 		 454 aa  582  1.0000000000000001e-165  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0870  N-formimino-L-glutamate deiminase  65.17 
 
 		 454 aa  582  1.0000000000000001e-165  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6453  N-formimino-L-glutamate deiminase  58.41 
 
 		 452 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.939265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2548  N-formimino-L-glutamate deiminase  59.38 
 
 		 456 aa  524  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1299  N-formimino-L-glutamate deiminase  58.5 
 
 		 491 aa  506  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00725  N-formimino-L-glutamate deiminase  56.67 
 
 		 456 aa  497  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0531221  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4634  N-formimino-L-glutamate deiminase  58.31 
 
 		 452 aa  485  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1687  N-formimino-L-glutamate deiminase  57.83 
 
 		 449 aa  481  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1655  N-formimino-L-glutamate deiminase  56.62 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0258161  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3003  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.33 
 
 		 454 aa  448  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1605  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.22 
 
 		 457 aa  451  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.544919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0709  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.89 
 
 		 453 aa  420  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361558  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5036  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.01 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2582  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.56 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.213363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0357  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.01 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5171  Atz/Trz family protein  48.12 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0165  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.45 
 
 		 469 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2960  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.22 
 
 		 473 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125073  normal  0.754686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4910  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.67 
 
 		 454 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.508756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5086  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.67 
 
 		 454 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1034  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.9 
 
 		 483 aa  404  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0932501 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0428  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.34 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0367  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.57 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1577  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.78 
 
 		 455 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0446865  normal  0.202401 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5839  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.23 
 
 		 466 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4560  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.14 
 
 		 455 aa  398  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3649  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.12 
 
 		 477 aa  396  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0243931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67440  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.01 
 
 		 453 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2712  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.71 
 
 		 468 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.898098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2851  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.78 
 
 		 469 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26300  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.45 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.670476  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0155  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.21 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1302  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.8 
 
 		 455 aa  383  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2079  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.81 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4352  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.92 
 
 		 464 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3903  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.99 
 
 		 466 aa  378  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1853  formiminoglutamate deiminase  46.5 
 
 		 487 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1254  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.27 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1809  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.09 
 
 		 476 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665973  normal  0.477845 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5477  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.48 
 
 		 462 aa  365  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5910  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.17 
 
 		 458 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2167  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.17 
 
 		 458 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1103  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.51 
 
 		 458 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2942  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.26 
 
 		 475 aa  364  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2933  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.79 
 
 		 459 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2184  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.17 
 
 		 458 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2083  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.87 
 
 		 458 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.756392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2206  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.86 
 
 		 458 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2510  N-formimino-L-glutamate deiminase  42.83 
 
 		 456 aa  359  4e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2111  N-formimino-L-glutamate deiminase  42.83 
 
 		 456 aa  359  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.365467  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1825  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.14 
 
 		 460 aa  359  5e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256581  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2220  N-formimino-L-glutamate deiminase  42.6 
 
 		 456 aa  358  8e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1535  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.02 
 
 		 468 aa  358  9e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1745  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.89 
 
 		 456 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00942929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2718  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.93 
 
 		 460 aa  356  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2662  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.93 
 
 		 460 aa  356  5e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1676  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.93 
 
 		 460 aa  356  5e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0650  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.93 
 
 		 460 aa  356  5e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2924  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.93 
 
 		 460 aa  356  5e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2361  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.93 
 
 		 460 aa  356  5e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2654  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.45 
 
 		 454 aa  354  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2791  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.71 
 
 		 460 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1040  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  60.29 
 
 		 686 aa  343  4e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4154  N-formimino-L-glutamate deiminase  41.51 
 
 		 474 aa  296  6e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0569  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.36 
 
 		 465 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172488  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0596  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.27 
 
 		 465 aa  227  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5775  formiminoglutamate deiminase  34.76 
 
 		 453 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0604  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.83 
 
 		 465 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0612  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.3 
 
 		 446 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00720471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1413  amidohydrolase  36.14 
 
 		 436 aa  203  4e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467624  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0584  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.02 
 
 		 420 aa  200  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3639  amidohydrolase  36.28 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0895387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1780  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.8 
 
 		 452 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0039  formiminoglutamate deiminase  35.02 
 
 		 439 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0251  N-formimino-L-glutamate deiminase  31.57 
 
 		 477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6263  formiminoglutamate deiminase  37.06 
 
 		 429 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4451  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.41 
 
 		 439 aa  182  8.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3616  formiminoglutamate deiminase  33.33 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0953492  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0965  formiminoglutamate deiminase  33.41 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438421  normal  0.190111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1108  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.82 
 
 		 452 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0998  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.79 
 
 		 452 aa  170  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.648434  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4386  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.97 
 
 		 430 aa  162  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2998  formiminoglutamate deiminase  35.9 
 
 		 512 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1148  amidohydrolase  28.33 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.53 
 
 		 452 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  25.23 
 
 		 451 aa  90.9  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.14 
 
 		 451 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.25 
 
 		 451 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0482  amidohydrolase  25.42 
 
 		 416 aa  86.7  9e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2224  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.37 
 
 		 459 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.890081  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.45 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1111  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.98 
 
 		 458 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.54 
 
 		 449 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  26.51 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  22.2 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.30941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>