More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1148 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1148  amidohydrolase  100 
 
 
481 aa  954    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0569  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.33 
 
 
465 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172488  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0596  N-formimino-L-glutamate deiminase  40.31 
 
 
465 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0604  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.57 
 
 
465 aa  227  4e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0612  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.44 
 
 
446 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00720471  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3616  formiminoglutamate deiminase  33.18 
 
 
452 aa  172  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0953492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0251  N-formimino-L-glutamate deiminase  31.31 
 
 
477 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1780  N-formimino-L-glutamate deiminase  31.23 
 
 
452 aa  167  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1299  N-formimino-L-glutamate deiminase  30.51 
 
 
491 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0965  formiminoglutamate deiminase  31.6 
 
 
446 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438421  normal  0.190111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0357  N-formimino-L-glutamate deiminase  28.21 
 
 
454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0584  N-formimino-L-glutamate deiminase  31.65 
 
 
420 aa  152  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4352  N-formimino-L-glutamate deiminase  26.34 
 
 
464 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0998  N-formimino-L-glutamate deiminase  31.88 
 
 
452 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.648434  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0428  N-formimino-L-glutamate deiminase  28.6 
 
 
454 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179062  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2079  N-formimino-L-glutamate deiminase  27.94 
 
 
456 aa  150  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1108  N-formimino-L-glutamate deiminase  31.41 
 
 
452 aa  147  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5036  N-formimino-L-glutamate deiminase  29.29 
 
 
454 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1302  N-formimino-L-glutamate deiminase  28.4 
 
 
455 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5775  formiminoglutamate deiminase  32.79 
 
 
453 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00725  N-formimino-L-glutamate deiminase  30.58 
 
 
456 aa  144  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0531221  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2851  N-formimino-L-glutamate deiminase  28.44 
 
 
469 aa  143  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5839  N-formimino-L-glutamate deiminase  30.24 
 
 
466 aa  143  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26300  N-formimino-L-glutamate deiminase  29.49 
 
 
462 aa  142  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.670476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5171  Atz/Trz family protein  28.33 
 
 
454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1687  N-formimino-L-glutamate deiminase  31.23 
 
 
449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4451  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.18 
 
 
439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67440  N-formimino-L-glutamate deiminase  30.7 
 
 
453 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1853  formiminoglutamate deiminase  29.01 
 
 
487 aa  140  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2220  N-formimino-L-glutamate deiminase  26.08 
 
 
456 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2111  N-formimino-L-glutamate deiminase  25.85 
 
 
456 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.365467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2510  N-formimino-L-glutamate deiminase  25.85 
 
 
456 aa  138  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4560  N-formimino-L-glutamate deiminase  27.07 
 
 
455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4154  N-formimino-L-glutamate deiminase  30.05 
 
 
474 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4634  N-formimino-L-glutamate deiminase  30.49 
 
 
452 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0367  N-formimino-L-glutamate deiminase  27.49 
 
 
454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2548  N-formimino-L-glutamate deiminase  28.54 
 
 
456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0155  N-formimino-L-glutamate deiminase  29.46 
 
 
466 aa  133  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4910  N-formimino-L-glutamate deiminase  29.05 
 
 
454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.508756 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2582  N-formimino-L-glutamate deiminase  27.98 
 
 
457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.213363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5086  N-formimino-L-glutamate deiminase  29.05 
 
 
454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1605  N-formimino-L-glutamate deiminase  26.23 
 
 
457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.544919  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2998  formiminoglutamate deiminase  33.88 
 
 
512 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2712  N-formimino-L-glutamate deiminase  27.85 
 
 
468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.898098  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1825  N-formimino-L-glutamate deiminase  28.81 
 
 
460 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256581  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0039  formiminoglutamate deiminase  32.27 
 
 
439 aa  126  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5960  N-formimino-L-glutamate deiminase  28.33 
 
 
449 aa  126  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3003  N-formimino-L-glutamate deiminase  24.65 
 
 
454 aa  126  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4386  N-formimino-L-glutamate deiminase  29.48 
 
 
430 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1034  N-formimino-L-glutamate deiminase  28.64 
 
 
483 aa  124  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0932501 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3903  N-formimino-L-glutamate deiminase  24.72 
 
 
466 aa  123  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.456692  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1413  amidohydrolase  30.67 
 
 
436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1254  N-formimino-L-glutamate deiminase  25.23 
 
 
454 aa  118  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2662  N-formimino-L-glutamate deiminase  28.1 
 
 
460 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3639  amidohydrolase  29.7 
 
 
394 aa  117  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0895387  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2960  N-formimino-L-glutamate deiminase  30.3 
 
 
473 aa  117  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125073  normal  0.754686 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2445  amidohydrolase  27.44 
 
 
449 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0709  N-formimino-L-glutamate deiminase  26.6 
 
 
453 aa  117  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361558  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6921  N-formimino-L-glutamate deiminase  28.5 
 
 
448 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772055  normal  0.983522 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2791  N-formimino-L-glutamate deiminase  27.91 
 
 
460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0650  N-formimino-L-glutamate deiminase  27.85 
 
 
460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1676  N-formimino-L-glutamate deiminase  27.85 
 
 
460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2718  N-formimino-L-glutamate deiminase  27.85 
 
 
460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2361  N-formimino-L-glutamate deiminase  27.85 
 
 
460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2924  N-formimino-L-glutamate deiminase  27.85 
 
 
460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6453  N-formimino-L-glutamate deiminase  27.05 
 
 
452 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.939265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1697  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.65 
 
 
454 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1655  N-formimino-L-glutamate deiminase  27.96 
 
 
457 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0258161  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6263  formiminoglutamate deiminase  31.99 
 
 
429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2083  N-formimino-L-glutamate deiminase  25.22 
 
 
458 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.756392  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3649  N-formimino-L-glutamate deiminase  26.45 
 
 
477 aa  113  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0243931  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2654  N-formimino-L-glutamate deiminase  26.62 
 
 
454 aa  113  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1745  N-formimino-L-glutamate deiminase  27.84 
 
 
456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00942929  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1087  amidohydrolase  30.77 
 
 
435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1535  N-formimino-L-glutamate deiminase  24.3 
 
 
468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5910  N-formimino-L-glutamate deiminase  26.15 
 
 
458 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2167  N-formimino-L-glutamate deiminase  26.15 
 
 
458 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0768  amidohydrolase  27.74 
 
 
442 aa  111  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0368346  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2942  N-formimino-L-glutamate deiminase  24.35 
 
 
475 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2206  N-formimino-L-glutamate deiminase  25 
 
 
458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0165  N-formimino-L-glutamate deiminase  25.74 
 
 
469 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2016  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.5 
 
 
454 aa  110  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5925  N-formimino-L-glutamate deiminase  28.19 
 
 
448 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  0.12966 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5477  N-formimino-L-glutamate deiminase  25.71 
 
 
462 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2184  N-formimino-L-glutamate deiminase  25.93 
 
 
458 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389835  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  22.78 
 
 
420 aa  109  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  26.29 
 
 
464 aa  108  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1121  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.34 
 
 
454 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2987  N-formimino-L-glutamate deiminase  26.89 
 
 
450 aa  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1103  N-formimino-L-glutamate deiminase  25.63 
 
 
458 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271378  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0870  N-formimino-L-glutamate deiminase  27.48 
 
 
454 aa  107  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0928  N-formimino-L-glutamate deiminase  27.48 
 
 
454 aa  107  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3248  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.25 
 
 
452 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3024  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.25 
 
 
452 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883439  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39210  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  30.48 
 
 
437 aa  104  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.769589  normal  0.540692 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  25.35 
 
 
434 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2144  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.64 
 
 
455 aa  103  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0767906  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  24.93 
 
 
462 aa  103  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1915  amidohydrolase  25.98 
 
 
421 aa  103  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232567  normal  0.102109 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1054  hypothetical protein  26.46 
 
 
434 aa  102  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.587451  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>