More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0709 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0709  N-formimino-L-glutamate deiminase  100 
 
 		 453 aa  911    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1577  N-formimino-L-glutamate deiminase  59.07 
 
 		 455 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0446865  normal  0.202401 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3003  N-formimino-L-glutamate deiminase  54.77 
 
 		 454 aa  478  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2933  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.92 
 
 		 459 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6921  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.55 
 
 		 448 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772055  normal  0.983522 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5925  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.88 
 
 		 448 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  0.12966 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5960  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.89 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1605  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.47 
 
 		 457 aa  406  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.544919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00725  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.34 
 
 		 456 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0531221  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2987  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.57 
 
 		 450 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2548  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.56 
 
 		 456 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0870  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.74 
 
 		 454 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0928  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.74 
 
 		 454 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1299  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.01 
 
 		 491 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1437  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.36 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1687  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.86 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6453  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.72 
 
 		 452 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.939265 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4560  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.18 
 
 		 455 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1655  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.81 
 
 		 457 aa  375  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0258161  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1809  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.45 
 
 		 476 aa  361  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665973  normal  0.477845 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0428  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.27 
 
 		 454 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0357  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.16 
 
 		 454 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5839  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.62 
 
 		 466 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67440  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.39 
 
 		 453 aa  352  7e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2079  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.08 
 
 		 456 aa  352  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5036  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.9 
 
 		 454 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5171  Atz/Trz family protein  44.62 
 
 		 454 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4352  N-formimino-L-glutamate deiminase  40.78 
 
 		 464 aa  350  4e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2942  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.42 
 
 		 475 aa  350  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5477  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.54 
 
 		 462 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26300  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.48 
 
 		 462 aa  343  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.670476  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1103  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.9 
 
 		 458 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2111  N-formimino-L-glutamate deiminase  40.61 
 
 		 456 aa  340  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.365467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2510  N-formimino-L-glutamate deiminase  40.61 
 
 		 456 aa  340  4e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2206  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.42 
 
 		 458 aa  338  9e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2220  N-formimino-L-glutamate deiminase  40.39 
 
 		 456 aa  338  9e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2083  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.42 
 
 		 458 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.756392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1535  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.64 
 
 		 468 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1302  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.74 
 
 		 455 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1745  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.93 
 
 		 456 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00942929  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3903  N-formimino-L-glutamate deiminase  40 
 
 		 466 aa  335  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5910  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.89 
 
 		 458 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1853  formiminoglutamate deiminase  44.99 
 
 		 487 aa  335  1e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2167  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.89 
 
 		 458 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2184  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.89 
 
 		 458 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1825  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.76 
 
 		 460 aa  334  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256581  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4910  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.08 
 
 		 454 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.508756 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4634  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.31 
 
 		 452 aa  333  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2582  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.46 
 
 		 457 aa  333  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.213363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5086  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.85 
 
 		 454 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1254  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.08 
 
 		 454 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0367  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.39 
 
 		 454 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1034  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.71 
 
 		 483 aa  324  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0932501 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3649  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.05 
 
 		 477 aa  324  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0243931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2712  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.33 
 
 		 468 aa  322  6e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.898098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2851  N-formimino-L-glutamate deiminase  42.86 
 
 		 469 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0165  N-formimino-L-glutamate deiminase  41.74 
 
 		 469 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2654  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.86 
 
 		 454 aa  313  4.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2662  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.23 
 
 		 460 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2791  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.23 
 
 		 460 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2718  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.23 
 
 		 460 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0650  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.23 
 
 		 460 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2924  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.23 
 
 		 460 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0155  N-formimino-L-glutamate deiminase  42.99 
 
 		 466 aa  310  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1676  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.23 
 
 		 460 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2960  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.3 
 
 		 473 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125073  normal  0.754686 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2361  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.23 
 
 		 460 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4154  N-formimino-L-glutamate deiminase  40.09 
 
 		 474 aa  280  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1040  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  54.64 
 
 		 686 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3616  formiminoglutamate deiminase  39.41 
 
 		 452 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0953492  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5775  formiminoglutamate deiminase  35.24 
 
 		 453 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0569  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.14 
 
 		 465 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172488  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0596  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.61 
 
 		 465 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1780  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.28 
 
 		 452 aa  206  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0251  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.66 
 
 		 477 aa  202  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0039  formiminoglutamate deiminase  38.29 
 
 		 439 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0584  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.64 
 
 		 420 aa  194  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6263  formiminoglutamate deiminase  38.88 
 
 		 429 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0965  formiminoglutamate deiminase  34.73 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438421  normal  0.190111 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0604  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.2 
 
 		 465 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0612  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.49 
 
 		 446 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00720471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1108  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.23 
 
 		 452 aa  176  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2998  formiminoglutamate deiminase  36.34 
 
 		 512 aa  173  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0998  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.69 
 
 		 452 aa  172  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.648434  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3639  amidohydrolase  35.8 
 
 		 394 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0895387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4451  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.85 
 
 		 439 aa  163  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4386  N-formimino-L-glutamate deiminase  35 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1413  amidohydrolase  33.17 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467624  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1148  amidohydrolase  26.6 
 
 		 481 aa  117  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39210  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  29.31 
 
 		 437 aa  100  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.769589  normal  0.540692 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  30.81 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  25.5 
 
 		 435 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  28.29 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.78 
 
 		 451 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.78 
 
 		 484 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4281  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.68 
 
 		 451 aa  95.5  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142354  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  25.5 
 
 		 435 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  25.06 
 
 		 435 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  25.31 
 
 		 435 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  25.06 
 
 		 435 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>