More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1108 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1108  N-formimino-L-glutamate deiminase  100 
 
 		 452 aa  893    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0998  N-formimino-L-glutamate deiminase  89.82 
 
 		 452 aa  741    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.648434  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3616  formiminoglutamate deiminase  61.71 
 
 		 452 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0953492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1780  N-formimino-L-glutamate deiminase  58.9 
 
 		 452 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0251  N-formimino-L-glutamate deiminase  58.72 
 
 		 477 aa  468  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0039  formiminoglutamate deiminase  60.99 
 
 		 439 aa  441  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0965  formiminoglutamate deiminase  55.95 
 
 		 446 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438421  normal  0.190111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5775  formiminoglutamate deiminase  56.03 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2998  formiminoglutamate deiminase  56.91 
 
 		 512 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4386  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.58 
 
 		 430 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6263  formiminoglutamate deiminase  60.92 
 
 		 429 aa  358  8e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4451  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.97 
 
 		 439 aa  358  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0569  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.12 
 
 		 465 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172488  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0596  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.87 
 
 		 465 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0604  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.37 
 
 		 465 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1413  amidohydrolase  44.53 
 
 		 436 aa  249  7e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467624  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0584  N-formimino-L-glutamate deiminase  41.92 
 
 		 420 aa  249  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1302  N-formimino-L-glutamate deiminase  41.48 
 
 		 455 aa  233  6e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5036  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.75 
 
 		 454 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0612  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.58 
 
 		 446 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00720471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0357  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.53 
 
 		 454 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3639  amidohydrolase  47 
 
 		 394 aa  231  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0895387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67440  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.48 
 
 		 453 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1605  N-formimino-L-glutamate deiminase  41.65 
 
 		 457 aa  229  9e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.544919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5839  N-formimino-L-glutamate deiminase  40.15 
 
 		 466 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0428  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.42 
 
 		 454 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4154  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.25 
 
 		 474 aa  226  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2079  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.71 
 
 		 456 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2111  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.53 
 
 		 456 aa  223  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.365467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2510  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.53 
 
 		 456 aa  223  6e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2220  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.28 
 
 		 456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4910  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.21 
 
 		 454 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.508756 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1809  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.88 
 
 		 476 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665973  normal  0.477845 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5171  Atz/Trz family protein  34.87 
 
 		 454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0367  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.87 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5086  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.87 
 
 		 454 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1535  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.62 
 
 		 468 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2851  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.48 
 
 		 469 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4634  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.49 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1034  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.44 
 
 		 483 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0932501 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3649  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.76 
 
 		 477 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0243931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2712  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.64 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.898098  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4560  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.41 
 
 		 455 aa  203  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1299  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.95 
 
 		 491 aa  203  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3003  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.55 
 
 		 454 aa  202  9e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2942  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.48 
 
 		 475 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0155  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.97 
 
 		 466 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1655  N-formimino-L-glutamate deiminase  40.35 
 
 		 457 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0258161  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5477  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.71 
 
 		 462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0165  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.83 
 
 		 469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1103  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.32 
 
 		 458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5910  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.67 
 
 		 458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2167  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.67 
 
 		 458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2083  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.47 
 
 		 458 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.756392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26300  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.71 
 
 		 462 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.670476  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00725  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.18 
 
 		 456 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0531221  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0650  N-formimino-L-glutamate deiminase  40.78 
 
 		 460 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2718  N-formimino-L-glutamate deiminase  40.78 
 
 		 460 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6453  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.15 
 
 		 452 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.939265 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1676  N-formimino-L-glutamate deiminase  40.78 
 
 		 460 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2924  N-formimino-L-glutamate deiminase  40.78 
 
 		 460 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2361  N-formimino-L-glutamate deiminase  40.78 
 
 		 460 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2206  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.23 
 
 		 458 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2184  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.43 
 
 		 458 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2791  N-formimino-L-glutamate deiminase  40.45 
 
 		 460 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2662  N-formimino-L-glutamate deiminase  40.45 
 
 		 460 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1254  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.53 
 
 		 454 aa  195  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1825  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.09 
 
 		 460 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256581  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1687  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.94 
 
 		 449 aa  195  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3903  N-formimino-L-glutamate deiminase  32.63 
 
 		 466 aa  193  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2548  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.08 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2960  N-formimino-L-glutamate deiminase  40.84 
 
 		 473 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125073  normal  0.754686 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4352  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.59 
 
 		 464 aa  190  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1853  formiminoglutamate deiminase  36.74 
 
 		 487 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0709  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.87 
 
 		 453 aa  186  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2654  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.81 
 
 		 454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2582  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.22 
 
 		 457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.213363 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2987  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.97 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1437  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.13 
 
 		 455 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0928  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.54 
 
 		 454 aa  176  8e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0870  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.54 
 
 		 454 aa  176  8e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5925  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.14 
 
 		 448 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  0.12966 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1577  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.42 
 
 		 455 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0446865  normal  0.202401 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5960  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.87 
 
 		 449 aa  172  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6921  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.72 
 
 		 448 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772055  normal  0.983522 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1745  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.04 
 
 		 456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00942929  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1148  amidohydrolase  31.07 
 
 		 481 aa  154  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2933  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.01 
 
 		 459 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  31.31 
 
 		 445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1040  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  39.78 
 
 		 686 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3605  amidohydrolase  32.05 
 
 		 460 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  30.75 
 
 		 429 aa  133  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39210  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  31.33 
 
 		 437 aa  130  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.769589  normal  0.540692 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2773  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31.4 
 
 		 446 aa  129  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3434  amidohydrolase  28.8 
 
 		 462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1786  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  30.33 
 
 		 450 aa  128  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  29.21 
 
 		 432 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  26.92 
 
 		 434 aa  126  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4071  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  31.63 
 
 		 455 aa  126  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00785709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0677  amidohydrolase  31.46 
 
 		 444 aa  126  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>