More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5036 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5036  N-formimino-L-glutamate deiminase  100 
 
 		 454 aa  922    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5839  N-formimino-L-glutamate deiminase  78.68 
 
 		 466 aa  698    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5171  Atz/Trz family protein  79.74 
 
 		 454 aa  748    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0367  N-formimino-L-glutamate deiminase  81.06 
 
 		 454 aa  733    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4910  N-formimino-L-glutamate deiminase  97.58 
 
 		 454 aa  872    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.508756 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0357  N-formimino-L-glutamate deiminase  82.6 
 
 		 454 aa  783    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0428  N-formimino-L-glutamate deiminase  87.22 
 
 		 454 aa  809    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67440  N-formimino-L-glutamate deiminase  78.63 
 
 		 453 aa  693    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5086  N-formimino-L-glutamate deiminase  94.93 
 
 		 454 aa  848    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2079  N-formimino-L-glutamate deiminase  66.44 
 
 		 456 aa  603  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26300  N-formimino-L-glutamate deiminase  69.18 
 
 		 462 aa  598  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.670476  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4560  N-formimino-L-glutamate deiminase  62.11 
 
 		 455 aa  586  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2111  N-formimino-L-glutamate deiminase  63.11 
 
 		 456 aa  578  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.365467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2510  N-formimino-L-glutamate deiminase  63.11 
 
 		 456 aa  578  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2220  N-formimino-L-glutamate deiminase  62.89 
 
 		 456 aa  578  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3903  N-formimino-L-glutamate deiminase  57.87 
 
 		 466 aa  534  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1254  N-formimino-L-glutamate deiminase  60.4 
 
 		 454 aa  518  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2654  N-formimino-L-glutamate deiminase  60.84 
 
 		 454 aa  502  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2582  N-formimino-L-glutamate deiminase  57.11 
 
 		 457 aa  478  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.213363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2851  N-formimino-L-glutamate deiminase  54.41 
 
 		 469 aa  460  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00725  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.42 
 
 		 456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0531221  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2942  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.41 
 
 		 475 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2548  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.21 
 
 		 456 aa  444  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2712  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.25 
 
 		 468 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.898098  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1853  formiminoglutamate deiminase  50.31 
 
 		 487 aa  440  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4352  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.83 
 
 		 464 aa  436  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1825  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.42 
 
 		 460 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256581  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1809  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.18 
 
 		 476 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665973  normal  0.477845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6453  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.21 
 
 		 452 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.939265 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2184  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.77 
 
 		 458 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5477  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.88 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1302  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.33 
 
 		 455 aa  429  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5910  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.77 
 
 		 458 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2083  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.55 
 
 		 458 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.756392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2206  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.55 
 
 		 458 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2167  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.77 
 
 		 458 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1103  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.22 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1535  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.87 
 
 		 468 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1034  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.58 
 
 		 483 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0932501 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1437  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.55 
 
 		 455 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0155  N-formimino-L-glutamate deiminase  54.04 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3649  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.88 
 
 		 477 aa  418  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0243931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6921  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.22 
 
 		 448 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772055  normal  0.983522 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2791  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.86 
 
 		 460 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1299  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.01 
 
 		 491 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2718  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.86 
 
 		 460 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0650  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.86 
 
 		 460 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2662  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.86 
 
 		 460 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1676  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.86 
 
 		 460 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2361  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.86 
 
 		 460 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2924  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.86 
 
 		 460 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0928  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.78 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5925  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.78 
 
 		 448 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  0.12966 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4634  N-formimino-L-glutamate deiminase  54.4 
 
 		 452 aa  409  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2987  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.89 
 
 		 450 aa  411  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0870  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.78 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0165  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.23 
 
 		 469 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1605  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.68 
 
 		 457 aa  406  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.544919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5960  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.01 
 
 		 449 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1687  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.02 
 
 		 449 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2960  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.76 
 
 		 473 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125073  normal  0.754686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1655  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.11 
 
 		 457 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0258161  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3003  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.52 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0709  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.9 
 
 		 453 aa  350  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1577  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.36 
 
 		 455 aa  336  5e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0446865  normal  0.202401 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1745  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.7 
 
 		 456 aa  330  3e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00942929  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4154  N-formimino-L-glutamate deiminase  42.89 
 
 		 474 aa  315  7e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2933  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.67 
 
 		 459 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1040  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  50.55 
 
 		 686 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0569  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.41 
 
 		 465 aa  236  7e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172488  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0596  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.04 
 
 		 465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5775  formiminoglutamate deiminase  35.45 
 
 		 453 aa  235  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0604  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.2 
 
 		 465 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0251  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.19 
 
 		 477 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0612  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.77 
 
 		 446 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00720471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0039  formiminoglutamate deiminase  37.39 
 
 		 439 aa  217  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0584  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.62 
 
 		 420 aa  215  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1108  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.26 
 
 		 452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0998  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.77 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.648434  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3616  formiminoglutamate deiminase  35.99 
 
 		 452 aa  210  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0953492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1780  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.86 
 
 		 452 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0965  formiminoglutamate deiminase  33.99 
 
 		 446 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438421  normal  0.190111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3639  amidohydrolase  38.05 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0895387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6263  formiminoglutamate deiminase  36.54 
 
 		 429 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2998  formiminoglutamate deiminase  35.24 
 
 		 512 aa  197  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4451  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.88 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4386  N-formimino-L-glutamate deiminase  32.77 
 
 		 430 aa  186  8e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1413  amidohydrolase  34.24 
 
 		 436 aa  171  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467624  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1148  amidohydrolase  29.29 
 
 		 481 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.44 
 
 		 451 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.89 
 
 		 451 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2224  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.43 
 
 		 459 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.890081  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.15 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3705  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.27 
 
 		 451 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1111  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.38 
 
 		 458 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1262  amidohydrolase  26.43 
 
 		 453 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.84 
 
 		 449 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  24.71 
 
 		 435 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  24.94 
 
 		 435 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1826  amidohydrolase family protein  26.54 
 
 		 441 aa  94.4  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.559084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>