More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2079 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2220  N-formimino-L-glutamate deiminase  75.44 
 
 
456 aa  705    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2510  N-formimino-L-glutamate deiminase  75.66 
 
 
456 aa  705    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2111  N-formimino-L-glutamate deiminase  75.66 
 
 
456 aa  705    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.365467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2079  N-formimino-L-glutamate deiminase  100 
 
 
456 aa  932    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5171  Atz/Trz family protein  67.7 
 
 
454 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0367  N-formimino-L-glutamate deiminase  68.58 
 
 
454 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0357  N-formimino-L-glutamate deiminase  65.71 
 
 
454 aa  614  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0428  N-formimino-L-glutamate deiminase  65.49 
 
 
454 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179062  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5036  N-formimino-L-glutamate deiminase  66.44 
 
 
454 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1254  N-formimino-L-glutamate deiminase  66.67 
 
 
454 aa  591  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67440  N-formimino-L-glutamate deiminase  66.59 
 
 
453 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4910  N-formimino-L-glutamate deiminase  66.67 
 
 
454 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.508756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5086  N-formimino-L-glutamate deiminase  66.22 
 
 
454 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4560  N-formimino-L-glutamate deiminase  61.42 
 
 
455 aa  581  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5839  N-formimino-L-glutamate deiminase  65.7 
 
 
466 aa  579  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2654  N-formimino-L-glutamate deiminase  66.89 
 
 
454 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26300  N-formimino-L-glutamate deiminase  61.92 
 
 
462 aa  533  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.670476  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3903  N-formimino-L-glutamate deiminase  54.69 
 
 
466 aa  502  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.456692  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2851  N-formimino-L-glutamate deiminase  54.05 
 
 
469 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1809  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.44 
 
 
476 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665973  normal  0.477845 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2712  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.97 
 
 
468 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.898098  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1103  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.66 
 
 
458 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271378  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5910  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.89 
 
 
458 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2167  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.89 
 
 
458 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2184  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.66 
 
 
458 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389835  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2548  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.55 
 
 
456 aa  425  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5477  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.42 
 
 
462 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2942  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.14 
 
 
475 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2083  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.42 
 
 
458 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.756392  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1853  formiminoglutamate deiminase  48.44 
 
 
487 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2206  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.78 
 
 
458 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1535  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.56 
 
 
468 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0165  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.9 
 
 
469 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1825  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.44 
 
 
460 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256581  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1034  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.78 
 
 
483 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0932501 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00725  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.01 
 
 
456 aa  411  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0531221  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2960  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.3 
 
 
473 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125073  normal  0.754686 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3649  N-formimino-L-glutamate deiminase  50 
 
 
477 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0243931  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2582  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.11 
 
 
457 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.213363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0155  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.12 
 
 
466 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1302  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.45 
 
 
455 aa  404  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1605  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.64 
 
 
457 aa  404  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.544919  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4634  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.12 
 
 
452 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6453  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.87 
 
 
452 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.939265 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1299  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.23 
 
 
491 aa  392  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4352  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.65 
 
 
464 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0650  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.81 
 
 
460 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1676  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.81 
 
 
460 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2791  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.81 
 
 
460 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2718  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.81 
 
 
460 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2662  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.81 
 
 
460 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2361  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.81 
 
 
460 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2924  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.81 
 
 
460 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6921  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.14 
 
 
448 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772055  normal  0.983522 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5925  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.14 
 
 
448 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  0.12966 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1687  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.98 
 
 
449 aa  375  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2987  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.26 
 
 
450 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0928  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.68 
 
 
454 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0870  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.68 
 
 
454 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3003  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.9 
 
 
454 aa  366  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5960  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.81 
 
 
449 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1655  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.65 
 
 
457 aa  365  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0258161  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1437  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.85 
 
 
455 aa  364  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0709  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.08 
 
 
453 aa  352  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361558  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4154  N-formimino-L-glutamate deiminase  42.89 
 
 
474 aa  342  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1745  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.3 
 
 
456 aa  327  3e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00942929  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1577  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.57 
 
 
455 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0446865  normal  0.202401 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2933  N-formimino-L-glutamate deiminase  42.89 
 
 
459 aa  289  9e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1040  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  50.74 
 
 
686 aa  265  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5775  formiminoglutamate deiminase  35.23 
 
 
453 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0569  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.41 
 
 
465 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172488  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0596  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.45 
 
 
465 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0251  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.24 
 
 
477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1780  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.78 
 
 
452 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0604  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.8 
 
 
465 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0039  formiminoglutamate deiminase  38.78 
 
 
439 aa  216  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3616  formiminoglutamate deiminase  34.62 
 
 
452 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0953492  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0998  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.61 
 
 
452 aa  210  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.648434  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0612  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.94 
 
 
446 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00720471  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1108  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.77 
 
 
452 aa  202  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0584  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.87 
 
 
420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6263  formiminoglutamate deiminase  36.9 
 
 
429 aa  197  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3639  amidohydrolase  38.36 
 
 
394 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0895387  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2998  formiminoglutamate deiminase  35.33 
 
 
512 aa  189  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0965  formiminoglutamate deiminase  33.18 
 
 
446 aa  187  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438421  normal  0.190111 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4386  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.1 
 
 
430 aa  176  9e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1413  amidohydrolase  33.17 
 
 
436 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467624  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4451  N-formimino-L-glutamate deiminase  31.94 
 
 
439 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1148  amidohydrolase  27.94 
 
 
481 aa  150  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.54 
 
 
439 aa  95.9  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4918  amidohydrolase  27.16 
 
 
441 aa  95.5  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0118051  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1262  amidohydrolase  26.15 
 
 
453 aa  94.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  27.37 
 
 
458 aa  94  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  24.57 
 
 
444 aa  92.4  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.56 
 
 
444 aa  91.7  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  25 
 
 
432 aa  91.3  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  23.48 
 
 
484 aa  91.3  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  25.76 
 
 
440 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  23.48 
 
 
451 aa  90.9  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2224  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  24.32 
 
 
459 aa  87  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.890081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>