More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2942 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2184  N-formimino-L-glutamate deiminase  71.62 
 
 
458 aa  649    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389835  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5477  N-formimino-L-glutamate deiminase  72.27 
 
 
462 aa  672    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1809  N-formimino-L-glutamate deiminase  79.29 
 
 
476 aa  764    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665973  normal  0.477845 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1825  N-formimino-L-glutamate deiminase  70.54 
 
 
460 aa  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256581  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2942  N-formimino-L-glutamate deiminase  100 
 
 
475 aa  969    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5910  N-formimino-L-glutamate deiminase  71.83 
 
 
458 aa  651    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1103  N-formimino-L-glutamate deiminase  72.27 
 
 
458 aa  657    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271378  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2083  N-formimino-L-glutamate deiminase  71.21 
 
 
458 aa  667    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.756392  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2206  N-formimino-L-glutamate deiminase  70.63 
 
 
458 aa  665    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1535  N-formimino-L-glutamate deiminase  90.36 
 
 
468 aa  863    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2167  N-formimino-L-glutamate deiminase  71.83 
 
 
458 aa  651    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0650  N-formimino-L-glutamate deiminase  70.54 
 
 
460 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2718  N-formimino-L-glutamate deiminase  70.54 
 
 
460 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2791  N-formimino-L-glutamate deiminase  70.54 
 
 
460 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2662  N-formimino-L-glutamate deiminase  70.54 
 
 
460 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1676  N-formimino-L-glutamate deiminase  70.54 
 
 
460 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2361  N-formimino-L-glutamate deiminase  70.54 
 
 
460 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2924  N-formimino-L-glutamate deiminase  70.54 
 
 
460 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2851  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.67 
 
 
469 aa  475  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1034  N-formimino-L-glutamate deiminase  56.83 
 
 
483 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0932501 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2712  N-formimino-L-glutamate deiminase  54.64 
 
 
468 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.898098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0357  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.18 
 
 
454 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0428  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.19 
 
 
454 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179062  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5036  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.41 
 
 
454 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5171  Atz/Trz family protein  52.62 
 
 
454 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0155  N-formimino-L-glutamate deiminase  54.84 
 
 
466 aa  442  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3649  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.61 
 
 
477 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0243931  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0165  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.98 
 
 
469 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0367  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.4 
 
 
454 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2079  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.14 
 
 
456 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5839  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.94 
 
 
466 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4910  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.59 
 
 
454 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.508756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67440  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.62 
 
 
453 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5086  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.16 
 
 
454 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2960  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.35 
 
 
473 aa  422  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125073  normal  0.754686 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2510  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.77 
 
 
456 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2220  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.54 
 
 
456 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2111  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.77 
 
 
456 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.365467  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4560  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.44 
 
 
455 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6453  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.75 
 
 
452 aa  401  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.939265 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1299  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.11 
 
 
491 aa  398  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1605  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.12 
 
 
457 aa  396  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.544919  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1853  formiminoglutamate deiminase  47.86 
 
 
487 aa  392  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2548  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.89 
 
 
456 aa  394  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26300  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.22 
 
 
462 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.670476  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4352  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.62 
 
 
464 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1254  N-formimino-L-glutamate deiminase  50 
 
 
454 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2654  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.89 
 
 
454 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3903  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.72 
 
 
466 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.456692  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00725  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.75 
 
 
456 aa  376  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0531221  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1302  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.41 
 
 
455 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0928  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.79 
 
 
454 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0870  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.79 
 
 
454 aa  365  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1437  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.99 
 
 
455 aa  364  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1655  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.64 
 
 
457 aa  364  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0258161  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1687  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.5 
 
 
449 aa  361  2e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2987  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.48 
 
 
450 aa  361  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4634  N-formimino-L-glutamate deiminase  50 
 
 
452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6921  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.07 
 
 
448 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772055  normal  0.983522 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5960  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.26 
 
 
449 aa  351  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2582  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.48 
 
 
457 aa  351  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.213363 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5925  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.3 
 
 
448 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  0.12966 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0709  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.42 
 
 
453 aa  350  5e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361558  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3003  N-formimino-L-glutamate deiminase  45 
 
 
454 aa  347  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4154  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.16 
 
 
474 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1577  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.54 
 
 
455 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0446865  normal  0.202401 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1745  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.78 
 
 
456 aa  291  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00942929  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2933  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.87 
 
 
459 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1040  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  50 
 
 
686 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0596  N-formimino-L-glutamate deiminase  40.48 
 
 
465 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0569  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.52 
 
 
465 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172488  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0604  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.57 
 
 
465 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5775  formiminoglutamate deiminase  33.85 
 
 
453 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0612  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.12 
 
 
446 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00720471  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0251  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.26 
 
 
477 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0039  formiminoglutamate deiminase  36 
 
 
439 aa  199  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1108  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.71 
 
 
452 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3616  formiminoglutamate deiminase  34.27 
 
 
452 aa  192  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0953492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1780  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.49 
 
 
452 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3639  amidohydrolase  38.99 
 
 
394 aa  189  8e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0895387  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0998  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.91 
 
 
452 aa  186  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.648434  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0584  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.7 
 
 
420 aa  180  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6263  formiminoglutamate deiminase  35.84 
 
 
429 aa  176  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4386  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.08 
 
 
430 aa  176  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2998  formiminoglutamate deiminase  35.58 
 
 
512 aa  176  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0965  formiminoglutamate deiminase  33.11 
 
 
446 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438421  normal  0.190111 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4451  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.16 
 
 
439 aa  169  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1413  amidohydrolase  32.58 
 
 
436 aa  143  6e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467624  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1148  amidohydrolase  24.35 
 
 
481 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7024  amidohydrolase  27.61 
 
 
434 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1262  amidohydrolase  28.5 
 
 
453 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1786  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.83 
 
 
450 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  23.38 
 
 
432 aa  87  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1915  amidohydrolase  25.19 
 
 
421 aa  86.7  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232567  normal  0.102109 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.83 
 
 
447 aa  86.7  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1234  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.23 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.324176 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  24.95 
 
 
444 aa  84  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0145  amidohydrolase  25.68 
 
 
432 aa  83.6  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.53 
 
 
452 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  24.69 
 
 
435 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>