More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6921 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5925  N-formimino-L-glutamate deiminase  91.28 
 
 
448 aa  838    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  0.12966 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2987  N-formimino-L-glutamate deiminase  70.98 
 
 
450 aa  658    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6921  N-formimino-L-glutamate deiminase  100 
 
 
448 aa  908    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772055  normal  0.983522 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5960  N-formimino-L-glutamate deiminase  66.89 
 
 
449 aa  605  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1437  N-formimino-L-glutamate deiminase  62.02 
 
 
455 aa  560  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0928  N-formimino-L-glutamate deiminase  62.47 
 
 
454 aa  555  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0870  N-formimino-L-glutamate deiminase  62.47 
 
 
454 aa  555  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6453  N-formimino-L-glutamate deiminase  57.84 
 
 
452 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.939265 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1299  N-formimino-L-glutamate deiminase  58.06 
 
 
491 aa  495  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2548  N-formimino-L-glutamate deiminase  56.03 
 
 
456 aa  481  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4634  N-formimino-L-glutamate deiminase  58.04 
 
 
452 aa  483  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00725  N-formimino-L-glutamate deiminase  54.44 
 
 
456 aa  457  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0531221  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3003  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.52 
 
 
454 aa  457  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1687  N-formimino-L-glutamate deiminase  54.25 
 
 
449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1655  N-formimino-L-glutamate deiminase  57.53 
 
 
457 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0258161  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0357  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.78 
 
 
454 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2582  N-formimino-L-glutamate deiminase  54.51 
 
 
457 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.213363 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1605  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.22 
 
 
457 aa  418  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.544919  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5036  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.22 
 
 
454 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0709  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.55 
 
 
453 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361558  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0428  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.34 
 
 
454 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179062  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5171  Atz/Trz family protein  48.46 
 
 
454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5839  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.66 
 
 
466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5086  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.88 
 
 
454 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67440  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.88 
 
 
453 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4560  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.47 
 
 
455 aa  403  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4910  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.22 
 
 
454 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.508756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0367  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.46 
 
 
454 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2851  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.36 
 
 
469 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0165  N-formimino-L-glutamate deiminase  51 
 
 
469 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3903  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.69 
 
 
466 aa  392  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.456692  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26300  N-formimino-L-glutamate deiminase  50 
 
 
462 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.670476  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1577  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.65 
 
 
455 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0446865  normal  0.202401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1034  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.6 
 
 
483 aa  388  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0932501 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0155  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.82 
 
 
466 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2712  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.8 
 
 
468 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.898098  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2079  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.14 
 
 
456 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2960  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.56 
 
 
473 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125073  normal  0.754686 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3649  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.8 
 
 
477 aa  378  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0243931  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1302  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.48 
 
 
455 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4352  N-formimino-L-glutamate deiminase  42.83 
 
 
464 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1254  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.47 
 
 
454 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1809  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.54 
 
 
476 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665973  normal  0.477845 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2111  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.56 
 
 
456 aa  363  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.365467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2510  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.56 
 
 
456 aa  363  4e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1825  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.58 
 
 
460 aa  362  6e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256581  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1853  formiminoglutamate deiminase  45.59 
 
 
487 aa  362  7.0000000000000005e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2220  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.33 
 
 
456 aa  362  9e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5477  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.77 
 
 
462 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2933  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.24 
 
 
459 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1535  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.51 
 
 
468 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2942  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.07 
 
 
475 aa  353  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2083  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.51 
 
 
458 aa  352  7e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.756392  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1745  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.11 
 
 
456 aa  352  8e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00942929  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2654  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.45 
 
 
454 aa  350  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2206  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.3 
 
 
458 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5910  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.82 
 
 
458 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2167  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.82 
 
 
458 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2184  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.82 
 
 
458 aa  349  7e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389835  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1103  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.35 
 
 
458 aa  346  5e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271378  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2662  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.93 
 
 
460 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2718  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.93 
 
 
460 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0650  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.93 
 
 
460 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2791  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.93 
 
 
460 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1676  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.93 
 
 
460 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2361  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.93 
 
 
460 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2924  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.93 
 
 
460 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1040  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  60.65 
 
 
686 aa  331  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4154  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.43 
 
 
474 aa  301  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5775  formiminoglutamate deiminase  36.83 
 
 
453 aa  226  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0569  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.29 
 
 
465 aa  212  9e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172488  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0596  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.78 
 
 
465 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0604  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.76 
 
 
465 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0584  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.1 
 
 
420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0612  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.93 
 
 
446 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00720471  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0251  N-formimino-L-glutamate deiminase  30.39 
 
 
477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1780  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.65 
 
 
452 aa  183  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3639  amidohydrolase  36.19 
 
 
394 aa  183  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0895387  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0039  formiminoglutamate deiminase  34.27 
 
 
439 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0965  formiminoglutamate deiminase  33.55 
 
 
446 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438421  normal  0.190111 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1413  amidohydrolase  37.37 
 
 
436 aa  172  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467624  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6263  formiminoglutamate deiminase  35.19 
 
 
429 aa  172  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1108  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.82 
 
 
452 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4451  N-formimino-L-glutamate deiminase  32.91 
 
 
439 aa  166  9e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0998  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.42 
 
 
452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.648434  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3616  formiminoglutamate deiminase  32.49 
 
 
452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0953492  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4386  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.21 
 
 
430 aa  163  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2998  formiminoglutamate deiminase  35.14 
 
 
512 aa  156  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1148  amidohydrolase  28.5 
 
 
481 aa  116  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  27.32 
 
 
440 aa  90.5  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.51 
 
 
452 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0482  amidohydrolase  27.67 
 
 
416 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.07 
 
 
449 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.21 
 
 
449 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.81 
 
 
451 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  23.52 
 
 
422 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  28.39 
 
 
440 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2224  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.67 
 
 
459 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.890081  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0086  amidohydrolase  23.28 
 
 
422 aa  81.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2226  amidohydrolase  25.99 
 
 
453 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>