More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2851 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2712  N-formimino-L-glutamate deiminase  80.56 
 
 		 468 aa  758    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.898098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2851  N-formimino-L-glutamate deiminase  100 
 
 		 469 aa  947    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1034  N-formimino-L-glutamate deiminase  62.42 
 
 		 483 aa  557  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0932501 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0155  N-formimino-L-glutamate deiminase  64.29 
 
 		 466 aa  550  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0165  N-formimino-L-glutamate deiminase  62.69 
 
 		 469 aa  546  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2960  N-formimino-L-glutamate deiminase  63.17 
 
 		 473 aa  525  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125073  normal  0.754686 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3649  N-formimino-L-glutamate deiminase  59.09 
 
 		 477 aa  519  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0243931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1809  N-formimino-L-glutamate deiminase  58.67 
 
 		 476 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665973  normal  0.477845 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1103  N-formimino-L-glutamate deiminase  60.23 
 
 		 458 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5477  N-formimino-L-glutamate deiminase  57.51 
 
 		 462 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2184  N-formimino-L-glutamate deiminase  59.45 
 
 		 458 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2942  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.67 
 
 		 475 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5910  N-formimino-L-glutamate deiminase  59.68 
 
 		 458 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2167  N-formimino-L-glutamate deiminase  59.68 
 
 		 458 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2083  N-formimino-L-glutamate deiminase  57.23 
 
 		 458 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.756392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5839  N-formimino-L-glutamate deiminase  56.25 
 
 		 466 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1825  N-formimino-L-glutamate deiminase  56.72 
 
 		 460 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256581  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2206  N-formimino-L-glutamate deiminase  56.81 
 
 		 458 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0357  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.33 
 
 		 454 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1535  N-formimino-L-glutamate deiminase  54.51 
 
 		 468 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5171  Atz/Trz family protein  53.12 
 
 		 454 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5036  N-formimino-L-glutamate deiminase  54.41 
 
 		 454 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0650  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.96 
 
 		 460 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2791  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.96 
 
 		 460 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1676  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.96 
 
 		 460 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0428  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.76 
 
 		 454 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2361  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.96 
 
 		 460 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2924  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.96 
 
 		 460 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67440  N-formimino-L-glutamate deiminase  54.53 
 
 		 453 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2718  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.96 
 
 		 460 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2662  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.74 
 
 		 460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4910  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.48 
 
 		 454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.508756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0367  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.33 
 
 		 454 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2079  N-formimino-L-glutamate deiminase  54.05 
 
 		 456 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5086  N-formimino-L-glutamate deiminase  54.62 
 
 		 454 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4560  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.43 
 
 		 455 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26300  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.1 
 
 		 462 aa  433  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.670476  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2111  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.43 
 
 		 456 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.365467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2510  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.43 
 
 		 456 aa  432  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2220  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.21 
 
 		 456 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2582  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.92 
 
 		 457 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.213363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1853  formiminoglutamate deiminase  49.59 
 
 		 487 aa  413  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4352  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.13 
 
 		 464 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1302  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.11 
 
 		 455 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4634  N-formimino-L-glutamate deiminase  56.73 
 
 		 452 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1299  N-formimino-L-glutamate deiminase  54.57 
 
 		 491 aa  398  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6453  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.86 
 
 		 452 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.939265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2548  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.87 
 
 		 456 aa  392  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6921  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.36 
 
 		 448 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772055  normal  0.983522 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5925  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.72 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  0.12966 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0928  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.16 
 
 		 454 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1254  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.79 
 
 		 454 aa  388  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1605  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.13 
 
 		 457 aa  387  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.544919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0870  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.16 
 
 		 454 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5960  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.25 
 
 		 449 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3903  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.92 
 
 		 466 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1437  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.01 
 
 		 455 aa  382  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2654  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.12 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2987  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.06 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00725  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.92 
 
 		 456 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0531221  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1687  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.55 
 
 		 449 aa  369  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3003  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.09 
 
 		 454 aa  363  4e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1655  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.54 
 
 		 457 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0258161  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4154  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.31 
 
 		 474 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0709  N-formimino-L-glutamate deiminase  42.86 
 
 		 453 aa  320  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1577  N-formimino-L-glutamate deiminase  47 
 
 		 455 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0446865  normal  0.202401 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1745  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.28 
 
 		 456 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00942929  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2933  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.71 
 
 		 459 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1040  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  54.26 
 
 		 686 aa  272  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5775  formiminoglutamate deiminase  37.02 
 
 		 453 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0569  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.81 
 
 		 465 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172488  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0596  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.34 
 
 		 465 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4451  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.98 
 
 		 439 aa  219  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0604  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.09 
 
 		 465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0039  formiminoglutamate deiminase  37.32 
 
 		 439 aa  203  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0998  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.73 
 
 		 452 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.648434  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0584  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.3 
 
 		 420 aa  201  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0251  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.66 
 
 		 477 aa  200  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1108  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.19 
 
 		 452 aa  200  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1780  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.43 
 
 		 452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0612  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.1 
 
 		 446 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00720471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0965  formiminoglutamate deiminase  37 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438421  normal  0.190111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2998  formiminoglutamate deiminase  37.02 
 
 		 512 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3639  amidohydrolase  38.94 
 
 		 394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0895387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6263  formiminoglutamate deiminase  36.96 
 
 		 429 aa  182  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4386  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.3 
 
 		 430 aa  179  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3616  formiminoglutamate deiminase  35.78 
 
 		 452 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0953492  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1413  amidohydrolase  36.59 
 
 		 436 aa  157  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467624  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1148  amidohydrolase  28.44 
 
 		 481 aa  143  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.1 
 
 		 451 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.18 
 
 		 451 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.8 
 
 		 449 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1111  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.38 
 
 		 458 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.53 
 
 		 449 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3248  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.52 
 
 		 452 aa  87  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.82 
 
 		 452 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3024  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.18 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1121  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.99 
 
 		 454 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2144  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.67 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0767906  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1262  amidohydrolase  28.04 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>