217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2933 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2933  N-formimino-L-glutamate deiminase  100 
 
 		 459 aa  894    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1577  N-formimino-L-glutamate deiminase  91.72 
 
 		 455 aa  755    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0446865  normal  0.202401 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0709  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.92 
 
 		 453 aa  477  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3003  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.43 
 
 		 454 aa  432  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1605  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.55 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.544919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1299  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.99 
 
 		 491 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5925  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.54 
 
 		 448 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  0.12966 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6921  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.11 
 
 		 448 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772055  normal  0.983522 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2987  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.33 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2548  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.11 
 
 		 456 aa  381  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5960  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.67 
 
 		 449 aa  382  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0928  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.58 
 
 		 454 aa  375  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0870  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.58 
 
 		 454 aa  375  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1437  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.58 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00725  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.35 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0531221  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1655  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.09 
 
 		 457 aa  361  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0258161  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6453  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.93 
 
 		 452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.939265 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4560  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.44 
 
 		 455 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4634  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.57 
 
 		 452 aa  345  8.999999999999999e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0428  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.65 
 
 		 454 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5839  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.94 
 
 		 466 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5036  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.67 
 
 		 454 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1687  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.22 
 
 		 449 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0357  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.47 
 
 		 454 aa  340  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5171  Atz/Trz family protein  44.03 
 
 		 454 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1302  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.32 
 
 		 455 aa  336  5e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67440  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.71 
 
 		 453 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4352  N-formimino-L-glutamate deiminase  41.58 
 
 		 464 aa  327  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1745  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.38 
 
 		 456 aa  326  6e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00942929  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2510  N-formimino-L-glutamate deiminase  41.98 
 
 		 456 aa  325  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2111  N-formimino-L-glutamate deiminase  41.98 
 
 		 456 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.365467  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2220  N-formimino-L-glutamate deiminase  41.76 
 
 		 456 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1853  formiminoglutamate deiminase  45.73 
 
 		 487 aa  322  7e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2942  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.87 
 
 		 475 aa  322  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0367  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.47 
 
 		 454 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2079  N-formimino-L-glutamate deiminase  42.89 
 
 		 456 aa  321  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5086  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.65 
 
 		 454 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4910  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.89 
 
 		 454 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.508756 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2582  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.94 
 
 		 457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.213363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2712  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.3 
 
 		 468 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.898098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2851  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.71 
 
 		 469 aa  312  7.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1254  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.23 
 
 		 454 aa  312  9e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26300  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.97 
 
 		 462 aa  311  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.670476  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1809  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.28 
 
 		 476 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665973  normal  0.477845 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3649  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.54 
 
 		 477 aa  310  4e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0243931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5477  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.45 
 
 		 462 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2960  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.43 
 
 		 473 aa  309  8e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125073  normal  0.754686 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1825  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.92 
 
 		 460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256581  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0155  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.05 
 
 		 466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2083  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.98 
 
 		 458 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.756392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0165  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.93 
 
 		 469 aa  308  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1535  N-formimino-L-glutamate deiminase  42.64 
 
 		 468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3903  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.48 
 
 		 466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5910  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.44 
 
 		 458 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2167  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.44 
 
 		 458 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2184  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.44 
 
 		 458 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2206  N-formimino-L-glutamate deiminase  42.89 
 
 		 458 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1103  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.8 
 
 		 458 aa  302  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2654  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.16 
 
 		 454 aa  296  5e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1034  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.39 
 
 		 483 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0932501 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0650  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.95 
 
 		 460 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2361  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.95 
 
 		 460 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2924  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.95 
 
 		 460 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2718  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.95 
 
 		 460 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1676  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.95 
 
 		 460 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2791  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.95 
 
 		 460 aa  289  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2662  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.95 
 
 		 460 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1040  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  57.89 
 
 		 686 aa  279  7e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4154  N-formimino-L-glutamate deiminase  42.41 
 
 		 474 aa  278  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1780  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.22 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0965  formiminoglutamate deiminase  34.62 
 
 		 446 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438421  normal  0.190111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3616  formiminoglutamate deiminase  35.23 
 
 		 452 aa  179  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0953492  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5775  formiminoglutamate deiminase  35.17 
 
 		 453 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0569  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.8 
 
 		 465 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172488  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0596  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.47 
 
 		 465 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0998  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.39 
 
 		 452 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.648434  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0604  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.55 
 
 		 465 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0612  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.34 
 
 		 446 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00720471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1108  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.76 
 
 		 452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3639  amidohydrolase  37.5 
 
 		 394 aa  164  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0895387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0251  N-formimino-L-glutamate deiminase  32.32 
 
 		 477 aa  163  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0584  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.52 
 
 		 420 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0039  formiminoglutamate deiminase  35.01 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2998  formiminoglutamate deiminase  36.32 
 
 		 512 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1413  amidohydrolase  34.1 
 
 		 436 aa  147  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467624  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6263  formiminoglutamate deiminase  34.68 
 
 		 429 aa  143  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4386  N-formimino-L-glutamate deiminase  32.27 
 
 		 430 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4451  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.33 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1148  amidohydrolase  28.05 
 
 		 481 aa  98.2  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  24.69 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  30.45 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  24.44 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  24.44 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  24.44 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  24.26 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  24.26 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  24.26 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  24.44 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  24.44 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  24.2 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>