More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4386 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4386  N-formimino-L-glutamate deiminase  100 
 
 		 430 aa  857    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3616  formiminoglutamate deiminase  54.09 
 
 		 452 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0953492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1780  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.74 
 
 		 452 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0251  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.57 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0998  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.15 
 
 		 452 aa  363  3e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.648434  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0039  formiminoglutamate deiminase  52.83 
 
 		 439 aa  361  1e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1108  N-formimino-L-glutamate deiminase  54.9 
 
 		 452 aa  361  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0965  formiminoglutamate deiminase  48.81 
 
 		 446 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438421  normal  0.190111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6263  formiminoglutamate deiminase  53.27 
 
 		 429 aa  339  5.9999999999999996e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5775  formiminoglutamate deiminase  48.6 
 
 		 453 aa  338  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4451  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.91 
 
 		 439 aa  323  4e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2998  formiminoglutamate deiminase  47.74 
 
 		 512 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0569  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.91 
 
 		 465 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172488  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0596  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.44 
 
 		 465 aa  219  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1302  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.63 
 
 		 455 aa  212  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0584  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.39 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0604  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.14 
 
 		 465 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1413  amidohydrolase  40.62 
 
 		 436 aa  204  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467624  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0428  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.12 
 
 		 454 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179062  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4352  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.42 
 
 		 464 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0357  N-formimino-L-glutamate deiminase  32.96 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2548  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.89 
 
 		 456 aa  187  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5086  N-formimino-L-glutamate deiminase  32.89 
 
 		 454 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5036  N-formimino-L-glutamate deiminase  32.77 
 
 		 454 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4910  N-formimino-L-glutamate deiminase  32.55 
 
 		 454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.508756 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2510  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.99 
 
 		 456 aa  184  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0367  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.22 
 
 		 454 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2111  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.99 
 
 		 456 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.365467  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2220  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.74 
 
 		 456 aa  183  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1825  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.09 
 
 		 460 aa  183  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256581  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0155  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.44 
 
 		 466 aa  182  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2184  N-formimino-L-glutamate deiminase  40 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5910  N-formimino-L-glutamate deiminase  40 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2167  N-formimino-L-glutamate deiminase  40 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3903  N-formimino-L-glutamate deiminase  30.91 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5839  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.53 
 
 		 466 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3649  N-formimino-L-glutamate deiminase  39 
 
 		 477 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0243931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5477  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.34 
 
 		 462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1034  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.66 
 
 		 483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0932501 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0612  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.15 
 
 		 446 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00720471  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5171  Atz/Trz family protein  34.88 
 
 		 454 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2851  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.3 
 
 		 469 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1535  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.32 
 
 		 468 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3639  amidohydrolase  39.62 
 
 		 394 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0895387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1605  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.32 
 
 		 457 aa  178  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.544919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2206  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.02 
 
 		 458 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67440  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.77 
 
 		 453 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2083  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.02 
 
 		 458 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.756392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1809  N-formimino-L-glutamate deiminase  32.95 
 
 		 476 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665973  normal  0.477845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4634  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.13 
 
 		 452 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00725  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.31 
 
 		 456 aa  176  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0531221  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2942  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.08 
 
 		 475 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2079  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.1 
 
 		 456 aa  176  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0650  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.02 
 
 		 460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1676  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.02 
 
 		 460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2718  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.02 
 
 		 460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2924  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.02 
 
 		 460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2361  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.02 
 
 		 460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2791  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.34 
 
 		 460 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1687  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.7 
 
 		 449 aa  173  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1103  N-formimino-L-glutamate deiminase  40.13 
 
 		 458 aa  173  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2662  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.34 
 
 		 460 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4560  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.59 
 
 		 455 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2712  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.22 
 
 		 468 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.898098  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26300  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.04 
 
 		 462 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.670476  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4154  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.87 
 
 		 474 aa  171  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2960  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.34 
 
 		 473 aa  171  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125073  normal  0.754686 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1299  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.43 
 
 		 491 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1254  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.94 
 
 		 454 aa  166  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1853  formiminoglutamate deiminase  33.57 
 
 		 487 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6453  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.25 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.939265 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2654  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.87 
 
 		 454 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6921  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.21 
 
 		 448 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772055  normal  0.983522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0165  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.41 
 
 		 469 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5925  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.71 
 
 		 448 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  0.12966 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3003  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.2 
 
 		 454 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1655  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.1 
 
 		 457 aa  160  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0258161  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5960  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.97 
 
 		 449 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2987  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.09 
 
 		 450 aa  156  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1437  N-formimino-L-glutamate deiminase  32.84 
 
 		 455 aa  153  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0928  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.25 
 
 		 454 aa  151  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0709  N-formimino-L-glutamate deiminase  35 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0870  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.25 
 
 		 454 aa  151  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2582  N-formimino-L-glutamate deiminase  32.69 
 
 		 457 aa  149  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.213363 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1745  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.38 
 
 		 456 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00942929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1040  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  35.26 
 
 		 686 aa  137  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1577  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.16 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0446865  normal  0.202401 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  30.3 
 
 		 447 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1148  amidohydrolase  29.48 
 
 		 481 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0977  amidohydrolase  23.39 
 
 		 420 aa  113  6e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.588063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.31 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  30.12 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.23 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2933  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.08 
 
 		 459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.96 
 
 		 465 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.11 
 
 		 476 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0677  amidohydrolase  30.29 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.88 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.11 
 
 		 500 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  27.59 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>