More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5925 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6921  N-formimino-L-glutamate deiminase  91.28 
 
 
448 aa  838    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772055  normal  0.983522 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2987  N-formimino-L-glutamate deiminase  69.06 
 
 
450 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5925  N-formimino-L-glutamate deiminase  100 
 
 
448 aa  902    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  0.12966 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5960  N-formimino-L-glutamate deiminase  66.29 
 
 
449 aa  597  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0928  N-formimino-L-glutamate deiminase  63 
 
 
454 aa  564  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0870  N-formimino-L-glutamate deiminase  63 
 
 
454 aa  564  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1437  N-formimino-L-glutamate deiminase  62.36 
 
 
455 aa  561  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6453  N-formimino-L-glutamate deiminase  57.17 
 
 
452 aa  502  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.939265 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1299  N-formimino-L-glutamate deiminase  57.49 
 
 
491 aa  486  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4634  N-formimino-L-glutamate deiminase  57.94 
 
 
452 aa  483  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2548  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.7 
 
 
456 aa  475  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00725  N-formimino-L-glutamate deiminase  54.22 
 
 
456 aa  463  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0531221  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3003  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.3 
 
 
454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1687  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.24 
 
 
449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1655  N-formimino-L-glutamate deiminase  58.68 
 
 
457 aa  448  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0258161  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2582  N-formimino-L-glutamate deiminase  54.41 
 
 
457 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.213363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0357  N-formimino-L-glutamate deiminase  50 
 
 
454 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1605  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.67 
 
 
457 aa  420  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.544919  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5036  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.78 
 
 
454 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5839  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.54 
 
 
466 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0428  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.78 
 
 
454 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179062  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0709  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.88 
 
 
453 aa  411  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361558  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67440  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.32 
 
 
453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5171  Atz/Trz family protein  48.46 
 
 
454 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4560  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.47 
 
 
455 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0165  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.01 
 
 
469 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4910  N-formimino-L-glutamate deiminase  50 
 
 
454 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.508756 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1577  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.09 
 
 
455 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0446865  normal  0.202401 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26300  N-formimino-L-glutamate deiminase  50 
 
 
462 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.670476  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5086  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.22 
 
 
454 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1034  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.22 
 
 
483 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0932501 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0367  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.8 
 
 
454 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2712  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.57 
 
 
468 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.898098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2851  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.72 
 
 
469 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0155  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.68 
 
 
466 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2960  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.67 
 
 
473 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125073  normal  0.754686 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2079  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.14 
 
 
456 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3903  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.07 
 
 
466 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.456692  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1302  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.13 
 
 
455 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3649  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.6 
 
 
477 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0243931  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1825  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.02 
 
 
460 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256581  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2111  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.78 
 
 
456 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.365467  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2220  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.56 
 
 
456 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2510  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.78 
 
 
456 aa  368  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1254  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.47 
 
 
454 aa  368  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4352  N-formimino-L-glutamate deiminase  42.6 
 
 
464 aa  362  8e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5477  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.85 
 
 
462 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2933  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.67 
 
 
459 aa  359  5e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1809  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.77 
 
 
476 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665973  normal  0.477845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1853  formiminoglutamate deiminase  45.38 
 
 
487 aa  354  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1103  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.7 
 
 
458 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271378  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5910  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.82 
 
 
458 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1535  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.22 
 
 
468 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2167  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.82 
 
 
458 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2083  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.39 
 
 
458 aa  353  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.756392  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2184  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.82 
 
 
458 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389835  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2206  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.18 
 
 
458 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2942  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.3 
 
 
475 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2662  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.62 
 
 
460 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0650  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.62 
 
 
460 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1676  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.62 
 
 
460 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2654  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.59 
 
 
454 aa  347  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2718  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.62 
 
 
460 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2361  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.62 
 
 
460 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2924  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.62 
 
 
460 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2791  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.41 
 
 
460 aa  346  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1745  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.01 
 
 
456 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00942929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1040  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  60.29 
 
 
686 aa  330  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4154  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.32 
 
 
474 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5775  formiminoglutamate deiminase  37.28 
 
 
453 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0569  N-formimino-L-glutamate deiminase  37.32 
 
 
465 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172488  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0596  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.6 
 
 
465 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0604  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.36 
 
 
465 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0584  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.52 
 
 
420 aa  189  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1780  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.04 
 
 
452 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0612  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.97 
 
 
446 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00720471  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0251  N-formimino-L-glutamate deiminase  29.93 
 
 
477 aa  179  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3639  amidohydrolase  35.56 
 
 
394 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0895387  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0965  formiminoglutamate deiminase  33.57 
 
 
446 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438421  normal  0.190111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0039  formiminoglutamate deiminase  33.57 
 
 
439 aa  172  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1413  amidohydrolase  36.02 
 
 
436 aa  171  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467624  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1108  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.81 
 
 
452 aa  170  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3616  formiminoglutamate deiminase  33.33 
 
 
452 aa  169  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0953492  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0998  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.71 
 
 
452 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.648434  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4451  N-formimino-L-glutamate deiminase  34.37 
 
 
439 aa  167  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6263  formiminoglutamate deiminase  34.85 
 
 
429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4386  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.71 
 
 
430 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2998  formiminoglutamate deiminase  34.7 
 
 
512 aa  147  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1148  amidohydrolase  28.19 
 
 
481 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0675  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.46 
 
 
452 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100326  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.57 
 
 
451 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  28.06 
 
 
440 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0219  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.39 
 
 
449 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.697722  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.12 
 
 
451 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.47 
 
 
449 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  26.55 
 
 
432 aa  83.2  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  26.18 
 
 
440 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1707  amidohydrolase  26.08 
 
 
431 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000668627  normal  0.0323622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3248  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.4 
 
 
452 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0482  amidohydrolase  28.33 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.338769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>