More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2712 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2712  N-formimino-L-glutamate deiminase  100 
 
 		 468 aa  942    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.898098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2851  N-formimino-L-glutamate deiminase  80.56 
 
 		 469 aa  758    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0165  N-formimino-L-glutamate deiminase  63.56 
 
 		 469 aa  555  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1034  N-formimino-L-glutamate deiminase  62.23 
 
 		 483 aa  556  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0932501 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0155  N-formimino-L-glutamate deiminase  64.21 
 
 		 466 aa  544  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2960  N-formimino-L-glutamate deiminase  63.09 
 
 		 473 aa  522  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.125073  normal  0.754686 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3649  N-formimino-L-glutamate deiminase  58.42 
 
 		 477 aa  508  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0243931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1809  N-formimino-L-glutamate deiminase  57.36 
 
 		 476 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665973  normal  0.477845 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1103  N-formimino-L-glutamate deiminase  58.64 
 
 		 458 aa  484  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2184  N-formimino-L-glutamate deiminase  58.41 
 
 		 458 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2083  N-formimino-L-glutamate deiminase  56.1 
 
 		 458 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.756392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5477  N-formimino-L-glutamate deiminase  56.1 
 
 		 462 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5910  N-formimino-L-glutamate deiminase  58.64 
 
 		 458 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2167  N-formimino-L-glutamate deiminase  58.64 
 
 		 458 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2206  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.67 
 
 		 458 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1825  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.27 
 
 		 460 aa  464  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256581  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2942  N-formimino-L-glutamate deiminase  54.64 
 
 		 475 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1535  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.13 
 
 		 468 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5171  Atz/Trz family protein  52.37 
 
 		 454 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5036  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.25 
 
 		 454 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0650  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.27 
 
 		 460 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2791  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.27 
 
 		 460 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0357  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.62 
 
 		 454 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1676  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.27 
 
 		 460 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2924  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.27 
 
 		 460 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2718  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.27 
 
 		 460 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2662  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.27 
 
 		 460 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2361  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.27 
 
 		 460 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5839  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.9 
 
 		 466 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2220  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.99 
 
 		 456 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0428  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.38 
 
 		 454 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.179062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2111  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.21 
 
 		 456 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.365467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2510  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.21 
 
 		 456 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394425 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2079  N-formimino-L-glutamate deiminase  52.97 
 
 		 456 aa  433  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4560  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.24 
 
 		 455 aa  427  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67440  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.15 
 
 		 453 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4910  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.46 
 
 		 454 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.508756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5086  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.46 
 
 		 454 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0367  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.62 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26300  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.74 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.670476  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2582  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.76 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.213363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1853  formiminoglutamate deiminase  50.41 
 
 		 487 aa  409  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4352  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.64 
 
 		 464 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1299  N-formimino-L-glutamate deiminase  53.83 
 
 		 491 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5925  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.57 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  0.12966 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1437  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.46 
 
 		 455 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3903  N-formimino-L-glutamate deiminase  45.09 
 
 		 466 aa  388  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2548  N-formimino-L-glutamate deiminase  51.19 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1302  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.9 
 
 		 455 aa  385  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4634  N-formimino-L-glutamate deiminase  55.05 
 
 		 452 aa  388  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6921  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.8 
 
 		 448 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772055  normal  0.983522 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1605  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.34 
 
 		 457 aa  384  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.544919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5960  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.52 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0870  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.62 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0928  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.62 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00725  N-formimino-L-glutamate deiminase  50 
 
 		 456 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0531221  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6453  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.8 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.939265 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2987  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.14 
 
 		 450 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1254  N-formimino-L-glutamate deiminase  48.26 
 
 		 454 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1687  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.36 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2654  N-formimino-L-glutamate deiminase  49.35 
 
 		 454 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3003  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.04 
 
 		 454 aa  358  9.999999999999999e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4154  N-formimino-L-glutamate deiminase  46.88 
 
 		 474 aa  347  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1655  N-formimino-L-glutamate deiminase  50.93 
 
 		 457 aa  346  6e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0258161  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0709  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.33 
 
 		 453 aa  322  6e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1577  N-formimino-L-glutamate deiminase  47.19 
 
 		 455 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0446865  normal  0.202401 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1745  N-formimino-L-glutamate deiminase  43.84 
 
 		 456 aa  300  3e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00942929  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2933  N-formimino-L-glutamate deiminase  44.3 
 
 		 459 aa  281  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1040  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  52.05 
 
 		 686 aa  256  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0569  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.11 
 
 		 465 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172488  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0596  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.41 
 
 		 465 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5775  formiminoglutamate deiminase  36.57 
 
 		 453 aa  225  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0604  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.74 
 
 		 465 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0584  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.97 
 
 		 420 aa  204  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0998  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.9 
 
 		 452 aa  203  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.648434  normal  0.167136 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0612  N-formimino-L-glutamate deiminase  39.95 
 
 		 446 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00720471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1108  N-formimino-L-glutamate deiminase  38.63 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0039  formiminoglutamate deiminase  36.56 
 
 		 439 aa  193  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0251  N-formimino-L-glutamate deiminase  35.96 
 
 		 477 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1780  N-formimino-L-glutamate deiminase  33.54 
 
 		 452 aa  187  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4451  N-formimino-L-glutamate deiminase  39 
 
 		 439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0965  formiminoglutamate deiminase  34.99 
 
 		 446 aa  183  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0438421  normal  0.190111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3639  amidohydrolase  38.82 
 
 		 394 aa  179  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0895387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3616  formiminoglutamate deiminase  34.96 
 
 		 452 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0953492  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2998  formiminoglutamate deiminase  35.66 
 
 		 512 aa  173  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4386  N-formimino-L-glutamate deiminase  36.22 
 
 		 430 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6263  formiminoglutamate deiminase  35.79 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1413  amidohydrolase  36.36 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.467624  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1148  amidohydrolase  27.85 
 
 		 481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  26.25 
 
 		 462 aa  95.9  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1707  amidohydrolase  27.89 
 
 		 431 aa  94  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000668627  normal  0.0323622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0765  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.61 
 
 		 451 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0059  amidohydrolase  27.58 
 
 		 448 aa  89.4  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.312881  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3024  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.78 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2144  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.34 
 
 		 455 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0767906  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1111  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.47 
 
 		 458 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0669  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.08 
 
 		 451 aa  87  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.806632  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01750  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.39 
 
 		 449 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000738453  normal  0.736322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3248  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.39 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1121  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.89 
 
 		 454 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>