More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6444 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6444  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 234 aa  480  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4638  transcriptional regulator, GntR family  75.65 
 
 		 247 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1438  GntR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6920  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  42.92 
 
 		 239 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2358  histidine utilization repressor  45.65 
 
 		 244 aa  209  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00724  histidine utilization repressor  44.4 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0579746  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4635  GntR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195845  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0927  histidine utilization repressor  45.26 
 
 		 247 aa  200  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0869  histidine utilization repressor  45.26 
 
 		 247 aa  200  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.287597  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2547  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  41.88 
 
 		 242 aa  199  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5924  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  41.63 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354183  normal  0.182633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1300  histidine utilization repressor  43.42 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2988  histidine utilization repressor  39.57 
 
 		 241 aa  192  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6454  GntR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1656  histidine utilization repressor  44.78 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00445076  normal  0.818618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1040  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  45.65 
 
 		 686 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1686  GntR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1606  histidine utilization repressor  37.55 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.971553  normal  0.693248 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4087  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  41.75 
 
 		 195 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.489248 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5963  transcriptional regulator GntR family  39.39 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0075  histidine utilization repressor  37.07 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  36.21 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  36.21 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  35.78 
 
 		 245 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5445  histidine utilization repressor  35.34 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0118538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4895  histidine utilization repressor  35.34 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3229  histidine utilization repressor  35.19 
 
 		 245 aa  149  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0148  histidine utilization repressor  35.37 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 255 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  33.19 
 
 		 255 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  36.73 
 
 		 260 aa  145  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4219  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  35.59 
 
 		 245 aa  144  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3644  histidine utilization repressor  33.76 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1262  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 244 aa  135  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5049  histidine utilization repressor  30.47 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00586645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3905  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5085  histidine utilization repressor  31.72 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0853  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.122159  hitchhiker  0.00270002 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2171  histidine utilization repressor  30.84 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.39027  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2188  histidine utilization repressor  30.84 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2087  histidine utilization repressor  31.28 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0358  histidine utilization repressor  30.26 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.824022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2386  histidine utilization repressor  32.16 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5906  histidine utilization repressor  30.84 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5106  histidine utilization repressor  33.04 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0814369  hitchhiker  0.00493265 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2210  histidine utilization repressor  31.28 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4909  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3799  histidine utilization repressor  32.16 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4840  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  32.46 
 
 		 267 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.180839 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1531  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  31.42 
 
 		 231 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.250236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2946  histidine utilization repressor  31.42 
 
 		 231 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1166  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 261 aa  131  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.448437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5005  histidine utilization repressor  32.16 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1823  histidine utilization repressor  32.46 
 
 		 267 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325999  normal  0.489419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0429  histidine utilization repressor  30.84 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.245315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3606  histidine utilization repressor  31.72 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1821  histidine utilization repressor  30.97 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3722  histidine utilization repressor  31.72 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4641  histidine utilization repressor  31.72 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5462  histidine utilization repressor  31.72 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67420  histidine utilization genes repressor protein  31.28 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2795  histidine utilization repressor  30.97 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5838  histidine utilization repressor  31.28 
 
 		 250 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2365  histidine utilization repressor  30.97 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366137  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2722  histidine utilization repressor  30.97 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0646  histidine utilization repressor  30.97 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0366  histidine utilization repressor  30.84 
 
 		 273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1165  histidine utilization repressor  32.3 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2666  histidine utilization repressor  30.97 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154672  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5481  histidine utilization repressor  30.4 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1294  histidine utilization repressor  34.63 
 
 		 244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4940  histidine utilization repressor  31.03 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2920  histidine utilization repressor  30.97 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1680  histidine utilization repressor  30.97 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5035  histidine utilization repressor  30.84 
 
 		 248 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1099  histidine utilization repressor  29.52 
 
 		 231 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1044  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 269 aa  128  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1750  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0970545  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5172  histidine utilization repressor  29.96 
 
 		 249 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1813  histidine utilization repressor  30.53 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.167757 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4702  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0392151  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2112  histidine utilization repressor  28.38 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0082  histidine utilization repressor  29.33 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2511  histidine utilization repressor  28.38 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0551986 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2221  histidine utilization repressor  28.38 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2476  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  32.3 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00699876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4839  histidine utilization repressor  30.84 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3758  histidine utilization repressor  32.56 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0153453 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0916  histidine utilization repressor  30.4 
 
 		 241 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0397561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4698  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0884  histidine utilization repressor  30.4 
 
 		 241 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0825  histidine utilization repressor  30.4 
 
 		 241 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1929  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3001  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 217 aa  123  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.471781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0939  histidine utilization repressor  30.4 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.997369  normal  0.595643 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2882  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  31.86 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2648  histidine utilization repressor transcription regulator protein  31.42 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0895  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4068  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 250 aa  121  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232008  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>