More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A3412 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A3412  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
245 aa  497  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  99.18 
 
 
245 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3183  GntR family transcriptional regulator  95.08 
 
 
245 aa  480  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.529781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3424  transcriptional regulator, GntR family  95.49 
 
 
245 aa  481  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3111  GntR family transcriptional regulator  94.69 
 
 
245 aa  478  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3424  GntR family transcriptional regulator  94.26 
 
 
245 aa  476  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014089  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3204  GntR family transcriptional regulator  94.67 
 
 
245 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264865  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3458  GntR family transcriptional regulator  94.67 
 
 
245 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3436  transcriptional regulator, GntR family  93.88 
 
 
245 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 
237 aa  170  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  36.17 
 
 
237 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3202  transcriptional regulator, GntR family  39.22 
 
 
237 aa  152  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  35.74 
 
 
239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
238 aa  149  6e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
241 aa  145  6e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  35.59 
 
 
239 aa  141  9e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  33.48 
 
 
235 aa  132  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0191  transcriptional regulator  33.03 
 
 
241 aa  132  6.999999999999999e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.168496 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
233 aa  122  8e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 
232 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  29.46 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
238 aa  116  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
242 aa  109  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  26.55 
 
 
235 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  26.55 
 
 
235 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
243 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  29.46 
 
 
232 aa  107  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  27.96 
 
 
247 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
225 aa  106  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1687  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
243 aa  106  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  28.12 
 
 
233 aa  103  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.07 
 
 
240 aa  102  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  26.07 
 
 
240 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  26.07 
 
 
240 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.07 
 
 
240 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  26.07 
 
 
240 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.07 
 
 
240 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2016  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 
242 aa  102  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.47195  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
235 aa  101  9e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.58 
 
 
240 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4192  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
238 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 
249 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 
260 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 
238 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
238 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 
238 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
238 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 
249 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
248 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 
238 aa  99.4  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
238 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  25.75 
 
 
241 aa  97.1  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2552  transcriptional regulator, GntR family  27.43 
 
 
237 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0076  transcriptional regulator, GntR family  25.88 
 
 
235 aa  96.3  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.15859  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1622  transcriptional regulator, GntR family  25.88 
 
 
246 aa  95.5  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
232 aa  95.1  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0513  transcriptional regulator, GntR family  26.75 
 
 
288 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0559  transcriptional regulator  26.91 
 
 
242 aa  94.4  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000128597  hitchhiker  0.00000147754 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 
244 aa  94.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
236 aa  94  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 
232 aa  94.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 
240 aa  92.4  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 
239 aa  92  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  26.99 
 
 
232 aa  92  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 
270 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 
252 aa  90.5  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 
241 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  29.36 
 
 
236 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  29.36 
 
 
236 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
241 aa  89.7  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
235 aa  89.4  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  24.68 
 
 
240 aa  89  6e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  25.97 
 
 
256 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
236 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.83 
 
 
256 aa  87  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0054  transcriptional regulator, GntR family  25.51 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  25.35 
 
 
244 aa  86.3  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  23.83 
 
 
258 aa  86.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
284 aa  86.3  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  28.09 
 
 
236 aa  85.5  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  28.09 
 
 
236 aa  85.5  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  26.18 
 
 
250 aa  85.5  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0666  trehalose operon repressor  28.51 
 
 
236 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  28.09 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  28.09 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  28.09 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 
248 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0339408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>