More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5975 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 274 aa  545  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  74.9 
 
 		 251 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 249 aa  183  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1994  transcriptional regulator, GntR family  44.68 
 
 		 243 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  41.83 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1764  GntR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.140741  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  42.15 
 
 		 248 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 267 aa  171  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  42.13 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  38.61 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 376 aa  162  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  37.8 
 
 		 256 aa  161  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 274 aa  161  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  38.75 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 284 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  36.21 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  35.91 
 
 		 286 aa  142  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  35.39 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0894  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  37.78 
 
 		 280 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 243 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  32.46 
 
 		 247 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3533  GntR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 246 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 241 aa  135  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  34.53 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3817  transcriptional regulator, GntR family  37.34 
 
 		 256 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0594434  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 277 aa  131  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  35.19 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  35.09 
 
 		 240 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4833  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7148  transcriptional regulator, GntR family  30.49 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263147 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0722  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  41.54 
 
 		 278 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 238 aa  119  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4080  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.88 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.515439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0732  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.128467  decreased coverage  0.000000465533 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6218  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 246 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4103  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 240 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0995  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 249 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352191  normal  0.964514 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 239 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1823  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  33.48 
 
 		 243 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 255 aa  102  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  34.05 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  26.64 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  37.24 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 248 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3370  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 251 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 241 aa  95.9  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  37.07 
 
 		 238 aa  95.1  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>