More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0995 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0995  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 249 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352191  normal  0.964514 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1764  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.140741  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  37.87 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  37.08 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  35.27 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1994  transcriptional regulator, GntR family  34.71 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4080  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  36.24 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.515439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  36.25 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  36.25 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3533  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 		 245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 251 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.29 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 259 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 284 aa  115  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  32.91 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  33.88 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  33.88 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 308 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 271 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  32.49 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 376 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  31.95 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0955  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.468224  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 278 aa  105  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  30.74 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.86 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 258 aa  105  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3370  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4833  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6218  transcriptional regulator, GntR family  33.03 
 
 		 246 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0894  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.49 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7148  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 247 aa  95.1  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263147 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4103  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 		 242 aa  92.4  6e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 287 aa  92  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 232 aa  89.7  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  31.98 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 248 aa  89  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  28.69 
 
 		 248 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0722  GntR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 245 aa  89  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 286 aa  89  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 248 aa  89  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 249 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04320  transcriptional regulator GntR family  28.75 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>