More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2707 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 259 aa  529  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  70.63 
 
 		 258 aa  355  2.9999999999999997e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  64.34 
 
 		 274 aa  345  5e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  66.03 
 
 		 278 aa  344  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  63.74 
 
 		 284 aa  340  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  64.26 
 
 		 269 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  64.26 
 
 		 258 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  67.8 
 
 		 284 aa  334  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  65.46 
 
 		 376 aa  332  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  64.43 
 
 		 256 aa  332  5e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  63.02 
 
 		 266 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  63.02 
 
 		 266 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  67.65 
 
 		 274 aa  330  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  63.02 
 
 		 266 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  63.02 
 
 		 266 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  63.02 
 
 		 266 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  63.02 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  63.02 
 
 		 376 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  64.71 
 
 		 286 aa  330  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  62.79 
 
 		 256 aa  328  5.0000000000000004e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  65.98 
 
 		 270 aa  328  6e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  65.55 
 
 		 262 aa  328  8e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  62.92 
 
 		 267 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  66.13 
 
 		 266 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  66.95 
 
 		 274 aa  325  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  66.95 
 
 		 271 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  66.95 
 
 		 274 aa  325  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  65.04 
 
 		 262 aa  324  8.000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 264 aa  323  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  66.11 
 
 		 287 aa  322  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  67.09 
 
 		 274 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  67.09 
 
 		 274 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  67.09 
 
 		 274 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  67.51 
 
 		 266 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  60.49 
 
 		 242 aa  296  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  56.96 
 
 		 245 aa  285  7e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  55.27 
 
 		 245 aa  279  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  57.74 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  51.43 
 
 		 248 aa  246  3e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  47.08 
 
 		 249 aa  215  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0894  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  42.55 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3533  GntR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3817  transcriptional regulator, GntR family  41.5 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0594434  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  41.39 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 274 aa  159  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1764  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 265 aa  158  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.140741  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1994  transcriptional regulator, GntR family  38.66 
 
 		 243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 245 aa  145  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6218  transcriptional regulator, GntR family  33.89 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  34.62 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4103  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  33.76 
 
 		 240 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 245 aa  128  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4833  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7148  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263147 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  31.98 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0995  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352191  normal  0.964514 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  31.33 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0722  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  35.34 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  31.05 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  33.2 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  33.2 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 239 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 242 aa  99.8  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 252 aa  99.4  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 244 aa  99  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>