More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3882 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
243 aa  503  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  97.12 
 
 
248 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  97.12 
 
 
243 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  97.12 
 
 
243 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  97.12 
 
 
243 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  97.12 
 
 
243 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  95.56 
 
 
225 aa  449  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  96.92 
 
 
195 aa  391  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  95.9 
 
 
195 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  95.9 
 
 
195 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4184  transcriptional regulator, GntR family  95.68 
 
 
185 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000338347  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 
243 aa  260  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  51.05 
 
 
247 aa  254  6e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  42.02 
 
 
243 aa  208  8e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
255 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  41.1 
 
 
242 aa  186  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  41.63 
 
 
244 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  37.87 
 
 
260 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
233 aa  176  3e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  39.58 
 
 
246 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
266 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  39.66 
 
 
246 aa  171  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
244 aa  170  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  37.17 
 
 
233 aa  166  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  36.86 
 
 
243 aa  163  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  35.04 
 
 
252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  37.28 
 
 
232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
249 aa  161  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  37.71 
 
 
245 aa  160  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
249 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
247 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
236 aa  160  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  37.34 
 
 
240 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  35.98 
 
 
241 aa  159  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
256 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  39.92 
 
 
269 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
256 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  37.34 
 
 
242 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 
252 aa  159  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  37.34 
 
 
249 aa  158  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
256 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
256 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
246 aa  156  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
249 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  39.33 
 
 
252 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
241 aa  155  7e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
239 aa  154  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
256 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 
232 aa  154  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
242 aa  153  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
247 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 
246 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
239 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
256 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  35.27 
 
 
270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
268 aa  151  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  35.56 
 
 
246 aa  149  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
248 aa  149  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  35.47 
 
 
239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
248 aa  145  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.31 
 
 
243 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  36.4 
 
 
244 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
248 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
241 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
241 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.47 
 
 
243 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
240 aa  141  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  33.2 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 
242 aa  139  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 
285 aa  138  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  32.92 
 
 
245 aa  138  8.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
248 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0513  transcriptional regulator, GntR family  32.76 
 
 
288 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  34.48 
 
 
250 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
264 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  30.9 
 
 
255 aa  135  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 
245 aa  135  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
254 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 
261 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 
261 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 
256 aa  135  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  33.88 
 
 
248 aa  135  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  30.97 
 
 
235 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  34.91 
 
 
244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4635  transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 
250 aa  135  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000503298  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.33 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  31.06 
 
 
245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15390  transcriptional regulator  37.13 
 
 
277 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.457467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  31.56 
 
 
278 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>