More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1804 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
246 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  62.3 
 
 
245 aa  311  5.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  65.31 
 
 
245 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  65.29 
 
 
246 aa  305  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  62.04 
 
 
245 aa  300  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  62.86 
 
 
247 aa  298  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  55.23 
 
 
246 aa  267  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0958  transcriptional regulator, GntR family  52.46 
 
 
246 aa  258  6e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  56.61 
 
 
243 aa  257  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  56.2 
 
 
243 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  53.31 
 
 
246 aa  251  8.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  53.72 
 
 
242 aa  240  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  53.31 
 
 
246 aa  237  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  54.17 
 
 
252 aa  231  8.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3590  UbiC transcription regulator-associated domain protein  53.69 
 
 
247 aa  229  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00770  transcriptional regulator, GntR family  51.04 
 
 
255 aa  222  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0724  transcriptional regulator, GntR family  49.16 
 
 
259 aa  210  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.981034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  45.68 
 
 
248 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
248 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
243 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
243 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
243 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
243 aa  156  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
243 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  37.13 
 
 
243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  37.13 
 
 
247 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  40.34 
 
 
243 aa  143  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 
260 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
225 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
255 aa  135  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  38.94 
 
 
244 aa  131  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  35.42 
 
 
242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  35.86 
 
 
252 aa  125  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 
270 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
268 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
240 aa  122  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
246 aa  121  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  37.34 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 
242 aa  118  7.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 
248 aa  118  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 
233 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 
240 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
256 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  33.63 
 
 
240 aa  115  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  35.34 
 
 
239 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 
246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 
252 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  35.74 
 
 
238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  35.47 
 
 
246 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 
254 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  33.19 
 
 
240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  33.19 
 
 
240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5389  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  33.19 
 
 
240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  33.19 
 
 
240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.76 
 
 
263 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  33.19 
 
 
240 aa  111  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2332  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2381  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2288  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545924  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2489  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2377  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  34.3 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2768  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.62 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0513  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 
288 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
255 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
241 aa  108  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
241 aa  108  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 
245 aa  108  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 
254 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 
248 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  34.89 
 
 
254 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 
240 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02029  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.97 
 
 
248 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1556  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 
248 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.868549  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1546  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
248 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.599104  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1138  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 
248 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.252402  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3079  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 
248 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2388  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
248 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 
269 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0964  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
248 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  34.54 
 
 
195 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  29.96 
 
 
232 aa  107  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  34.54 
 
 
195 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01993  hypothetical protein  30.97 
 
 
248 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2237  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
248 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>