More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0283 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  479  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0422  GntR family transcriptional regulator  45.34 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207613  normal  0.0264294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  36.21 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  34.04 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  35.93 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  34.03 
 
 		 243 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  35.27 
 
 		 244 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 268 aa  139  6e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 249 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  31.67 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 256 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 239 aa  125  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 249 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 256 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 256 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  32.05 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.91 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  119  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  35.59 
 
 		 278 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 249 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 269 aa  118  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 258 aa  118  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 247 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  34.06 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  34.19 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  31.91 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  31.91 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  29.6 
 
 		 240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  29.6 
 
 		 240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  29.6 
 
 		 240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  29.6 
 
 		 240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  34.82 
 
 		 248 aa  111  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 248 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 195 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  29.33 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 195 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  29.33 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 195 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  32.62 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  31.33 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  30.13 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 274 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  30.64 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 278 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.63 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  32.6 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 242 aa  105  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 274 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 274 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 241 aa  105  7e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.61 
 
 		 256 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4033  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  33.19 
 
 		 244 aa  105  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0213  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  33.19 
 
 		 244 aa  105  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.41 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>