More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2152 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 269 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 258 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  90.73 
 
 		 274 aa  472  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  73.52 
 
 		 284 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  81.09 
 
 		 287 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  69.03 
 
 		 274 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  65.43 
 
 		 332 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  65.43 
 
 		 376 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  67.05 
 
 		 376 aa  362  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 266 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 266 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 266 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 266 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 266 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  72.46 
 
 		 274 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  65.43 
 
 		 266 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  72.03 
 
 		 274 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  72.03 
 
 		 271 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  65.06 
 
 		 267 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  72.88 
 
 		 274 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  72.88 
 
 		 274 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  72.88 
 
 		 274 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  64.26 
 
 		 259 aa  340  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  62.13 
 
 		 284 aa  336  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  70.76 
 
 		 266 aa  332  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 278 aa  329  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  64.73 
 
 		 270 aa  327  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  65.97 
 
 		 262 aa  325  7e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 262 aa  322  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  62.96 
 
 		 256 aa  322  4e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  62.6 
 
 		 256 aa  320  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  60.66 
 
 		 286 aa  319  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  63.12 
 
 		 258 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  57.56 
 
 		 264 aa  306  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  58.9 
 
 		 245 aa  297  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  58.47 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  59.66 
 
 		 242 aa  296  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  55.7 
 
 		 251 aa  269  5e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  49.59 
 
 		 248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  44.59 
 
 		 249 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3533  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0894  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  39.32 
 
 		 280 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1764  GntR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 265 aa  171  9e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.140741  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1994  transcriptional regulator, GntR family  39.66 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  35.6 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  36.53 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3817  transcriptional regulator, GntR family  36.43 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0594434  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 240 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  37.16 
 
 		 240 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  37.16 
 
 		 240 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 308 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 243 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6218  transcriptional regulator, GntR family  32.77 
 
 		 246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  34.76 
 
 		 277 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  34.33 
 
 		 240 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4103  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 246 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 241 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4833  GntR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7148  transcriptional regulator, GntR family  34.56 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263147 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 243 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0722  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  32.07 
 
 		 243 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  34.75 
 
 		 273 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 240 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  33.74 
 
 		 244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3370  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  33.76 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  33.76 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  34.84 
 
 		 248 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0995  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 249 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352191  normal  0.964514 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  32.77 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>