More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34690 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 244 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  71.13 
 
 		 249 aa  351  5.9999999999999994e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  63.95 
 
 		 269 aa  292  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 268 aa  286  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  58.72 
 
 		 242 aa  276  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  57.26 
 
 		 246 aa  274  7e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 248 aa  274  8e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  56.17 
 
 		 239 aa  262  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  58.55 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  48 
 
 		 244 aa  211  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 245 aa  206  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  46.52 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  47.35 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  43.35 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  45.22 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  45.06 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  47.21 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  42.79 
 
 		 245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1304  UbiC transcription regulator-associated domain protein  45.85 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  46.35 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  43.48 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  43.57 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0056  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  42.98 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210738 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  41.05 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1316  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  43.11 
 
 		 278 aa  165  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3820  transcriptional regulator, GntR family  42.17 
 
 		 260 aa  165  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0228383  hitchhiker  0.00324252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  41.88 
 
 		 246 aa  162  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  40.18 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 264 aa  162  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  43.35 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 247 aa  154  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5638  transcriptional regulator, GntR family  42.48 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  42.49 
 
 		 195 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  42.49 
 
 		 195 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  42.49 
 
 		 195 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 247 aa  151  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  38.94 
 
 		 238 aa  149  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 244 aa  148  9e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  39.65 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 240 aa  141  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  39.39 
 
 		 254 aa  141  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7203  transcriptional regulator, GntR family  37 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.277726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4184  transcriptional regulator, GntR family  42.31 
 
 		 185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000338347  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 240 aa  139  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05080  transcriptional regulator  41.15 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.764166  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 242 aa  135  5e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9090  putative transcriptional regulator, GntR family  41.15 
 
 		 240 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 286 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  37.61 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  31.76 
 
 		 240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 249 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  36.28 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  34.42 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  42.65 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.516335 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  41.63 
 
 		 285 aa  126  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  37.2 
 
 		 232 aa  124  9e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3517  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  39.48 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 232 aa  122  7e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0724  transcriptional regulator, GntR family  37.45 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.981034 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15390  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.457467 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0422  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207613  normal  0.0264294 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  34.78 
 
 		 239 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  34.78 
 
 		 239 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 258 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  35.19 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>