More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2752 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
225 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  95.56 
 
 
243 aa  449  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  94.22 
 
 
248 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  94.22 
 
 
243 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  94.22 
 
 
243 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  94.22 
 
 
243 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  94.22 
 
 
243 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  93.85 
 
 
195 aa  384  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  92.82 
 
 
195 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  92.82 
 
 
195 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4184  transcriptional regulator, GntR family  92.43 
 
 
185 aa  360  9e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000338347  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  50.45 
 
 
243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  50.67 
 
 
247 aa  235  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  42.98 
 
 
243 aa  196  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
255 aa  181  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  43.66 
 
 
244 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  41.74 
 
 
233 aa  171  9e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  41.1 
 
 
242 aa  171  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  39.91 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  42.4 
 
 
269 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 
246 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  36.87 
 
 
232 aa  159  5e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  36.41 
 
 
233 aa  158  8e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
247 aa  156  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  36.7 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  37.39 
 
 
242 aa  155  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
266 aa  155  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  39.17 
 
 
246 aa  154  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 
232 aa  152  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 
247 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
242 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  34.4 
 
 
252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 
232 aa  151  5.9999999999999996e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 
245 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
236 aa  151  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
249 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
240 aa  149  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
249 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  36.65 
 
 
241 aa  149  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
256 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 
268 aa  149  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
256 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  37.39 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
256 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  36.79 
 
 
239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  40.09 
 
 
252 aa  146  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  34.58 
 
 
252 aa  145  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
241 aa  146  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
243 aa  146  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  34.96 
 
 
270 aa  145  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
256 aa  145  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
249 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
239 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
256 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  34.53 
 
 
238 aa  143  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
248 aa  142  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
258 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
248 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
256 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  37.02 
 
 
244 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
241 aa  138  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  34.27 
 
 
245 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
246 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  35.02 
 
 
244 aa  135  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  34.91 
 
 
256 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  37.98 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  30.41 
 
 
235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  35.53 
 
 
250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 
278 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
248 aa  133  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 
248 aa  132  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  34.22 
 
 
245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
248 aa  131  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9090  putative transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 
240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.58 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  38.99 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 
264 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  34.98 
 
 
245 aa  129  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0513  transcriptional regulator, GntR family  31.56 
 
 
288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  35.94 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  31.31 
 
 
255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  34.84 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
248 aa  128  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
245 aa  128  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0213  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  33.33 
 
 
244 aa  128  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4033  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  33.33 
 
 
244 aa  128  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3820  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0228383  hitchhiker  0.00324252 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>