More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0433 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
238 aa  474  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  46.12 
 
 
244 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  40.52 
 
 
269 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  46.19 
 
 
243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  46.22 
 
 
266 aa  161  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  38.01 
 
 
243 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  45.27 
 
 
255 aa  156  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
248 aa  152  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  37.28 
 
 
247 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  43.98 
 
 
241 aa  151  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  38.94 
 
 
244 aa  149  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
268 aa  149  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  35.56 
 
 
246 aa  148  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  37.17 
 
 
249 aa  148  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  36.4 
 
 
239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5638  transcriptional regulator, GntR family  42.79 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
243 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
243 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
243 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
243 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  40.28 
 
 
245 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
225 aa  143  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
239 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  39.55 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05080  transcriptional regulator  40.99 
 
 
259 aa  139  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.764166  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
239 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 
252 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  39.91 
 
 
278 aa  138  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 
238 aa  138  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
255 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 
264 aa  135  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  38.36 
 
 
252 aa  134  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  35.4 
 
 
256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  40.59 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  39.04 
 
 
254 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  38.6 
 
 
254 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  36.97 
 
 
254 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  34.35 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  38.12 
 
 
246 aa  129  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  38.86 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
247 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  38.96 
 
 
257 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  37.84 
 
 
255 aa  126  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3517  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
238 aa  125  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0574  GntR family transcriptional regulator  44 
 
 
253 aa  125  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.391885  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  34.72 
 
 
195 aa  125  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
254 aa  125  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  34.72 
 
 
195 aa  125  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
219 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9090  putative transcriptional regulator, GntR family  40.44 
 
 
240 aa  124  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15390  transcriptional regulator  35.96 
 
 
277 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.457467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  38.05 
 
 
263 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
265 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
265 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
264 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  34.2 
 
 
195 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7203  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 
253 aa  122  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.277726  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 
257 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  39.61 
 
 
251 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  32.14 
 
 
233 aa  123  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  38.21 
 
 
242 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  38.12 
 
 
248 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 
252 aa  119  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
260 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
256 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
260 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  38.22 
 
 
246 aa  119  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.516335 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 
242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
274 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
257 aa  118  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
257 aa  118  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  37.09 
 
 
256 aa  118  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
244 aa  118  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0513  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 
288 aa  118  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  36.07 
 
 
232 aa  118  9e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  36.63 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  37.38 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1234  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.77 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.550496  normal  0.0276711 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  37.38 
 
 
285 aa  116  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  30.22 
 
 
244 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3820  transcriptional regulator, GntR family  36.16 
 
 
260 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0228383  hitchhiker  0.00324252 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
232 aa  115  6e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
249 aa  115  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  32.59 
 
 
239 aa  115  8.999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  36.54 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5574  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.33 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>